Dit is de Linux-app met de naam CaptureProbe waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Runningexample.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app met de naam CaptureProbe gratis online met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
CaptureProbe
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Hier hebben we CaptureProbe ontwikkeld, een gebruiksvriendelijke en grafische Java-tool voor het ontwerpen van capture-sondes voor Capture Hi-C-toepassingen. CaptureProbe is gebruiksvriendelijk, heeft alleen eenvoudige invoerbestanden nodig en biedt een overvloed aan parameters voor het ontwerpen van sondes. CaptureProbe kan sondes specifiek ontwerpen voor zowel genomische sites als genomische regio's van belang. Vergelijkingen met bestaande software (HiCapTools en GOPHER) gaven aan dat CaptureProbe een goede ontwerpsuccesverhouding en een betere sondespecificiteit heeft.
Visum: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: een Java-tool voor het ontwerpen van sondes voor Hi-C-toepassingen voor het vastleggen. Zool Res [J], 41: 94-96.
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
