Dit is de Linux-app FastQC, waarvan de nieuwste versie kan worden gedownload als v0.12.1sourcecode.zip. Deze kan online worden uitgevoerd via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam FastQC gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
Snelle QC
PRODUCTBESCHRIJVING
FastQC is een analysetool voor kwaliteitscontrole die is ontworpen om potentiële problemen in sequencing-datasets met hoge doorvoer op te sporen. Het doel is om een eenvoudige manier te bieden om de kwaliteit van onbewerkte sequentiegegevens te controleren die afkomstig zijn van sequencing-pijplijnen met hoge doorvoer. Het doet dit door een modulaire set analyses uit te voeren op een of meer onbewerkte sequentiebestanden in fastq- of bam-indeling. Vervolgens produceert het een rapport met een samenvatting van de resultaten en markeert het alle gebieden waar de bibliotheek ongebruikelijk lijkt. Dit zou u vervolgens moeten leiden naar waar uw gegevens problemen kunnen hebben en u in staat stellen de nodige stappen te ondernemen om deze te corrigeren voordat u verdere analyse uitvoert.
FastQC is niet gebonden aan een specifiek type sequentietechniek, dus het kan worden gebruikt om bibliotheken van verschillende experimenttypes te bekijken (Genomic Sequencing, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq enz.).
Kenmerken
- Importeert gegevens uit BAM-, SAM- of FastQ-bestanden
- Biedt een snel overzicht dat potentiële probleemgebieden benadrukt
- Samenvattende grafieken en tabellen voor een snelle beoordeling van gegevens
- Exporteer resultaten naar HTML
- Kan offline worden gebruikt
Programmeertaal
Java
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
