Dit is de Linux-app genaamd FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny om online in Linux te draaien waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als ffp-3.19.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny online uit om gratis online in Linux met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny om online in Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
FFP (Feature frequency profile) is een vergelijkingstool zonder uitlijning voor fylogenetische analyse en tekstvergelijking. Het kan worden toegepast op nucleotidesequenties, complete genomen, proteomen en zelfs worden gebruikt voor tekstvergelijking.Voordelen
- Vergelijking van genomen, eiwit- en nucleïnezuursequenties in FASTA-formaat
- Uitvoer van afstandsmatrix in Phylip-stijl
- Meer dan een dozijn afstandsmaatregelen
- Maakt gebruik van een snelle vergelijkingsmethode zonder uitlijning
- Implementatie van snelle Rabin-Karp hashing voor k-mer tellen
- Spaced-seed/masking hash-functie maakt mismatches van DNA/aminozuren mogelijk
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, onderwijs
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Unix-shell, Perl, C
Database-omgeving
Plat bestand
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/ffp-phylogeny/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.