Dit is de Linux-app met de naam HomSI die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als HomSI.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam HomSI online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
HomSI om online onder Linux te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
In bloedverwante families hebben de individuen, als resultaat van het erven van dezelfde genomische segmenten via beide ouders, delen van hun genoom die homozygoot zijn. Deze situatie leidt tot de prevalentie van recessieve ziekten onder de leden van deze families. Het in kaart brengen van homozygotie is gebaseerd op deze observatie en met behulp van deze techniek zijn verschillende recessieve ziektegenen ontdekt in bloedverwante families. De onderzoekers gebruiken doorgaans SNP-arrays om de homozygote regio's te bepalen en zoeken vervolgens naar het ziektegen door de genen binnen deze kandidaat-ziekteloci te sequencen. Onlangs heeft de komst van sequencing van de volgende generatie de gelijktijdige identificatie van homozygote regio's en de detectie van mutaties die relevant zijn voor de diagnose mogelijk gemaakt, met behulp van gegevens uit een enkel sequencing-experiment. In dit opzicht hebben we een nieuw hulpmiddel ontwikkeld dat homozygote regio's identificeert met behulp van diepgaande sequentiegegevens. Door *.vcf-bestanden als invoerbestand te gebruiken, identificeert ons programma de majoVoordelen
- Homozygotie in kaart brengen op NGS-gegevens
Gebruikersinterface
Java-SWT
Programmeertaal
Java
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/homsi/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
