Dit is de Linux-app genaamd INTEGRATE waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als INTEGRATE.0.2.6.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam INTEGRATE met OnWorks gratis online uit.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
INTEGREREN
PRODUCTBESCHRIJVING
INTEGREREN: Genfusies oproepen met exacte fusieverbindingen en genomische breekpunten door RNA-Seq- en WGS-gegevens te combineren.Om de broncode, referentiehandleiding en testcase te downloaden, gaat u naar 'Bestanden'.
Raadpleeg ook 'Wiki' voor details.
Voordelen
- Hoge sensitiviteit en specificiteit
- Exacte fusieverbindingen en genomische breekpunten
- Snel split-read mapping-algoritme gebaseerd op Burrows-Wheeler-transformatie
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/integrate-fusion/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.