Dit is de Linux-app genaamd MetaPhat -meta-pheno-association-tracker waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als meta_phat.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd MetaPhat -meta-pheno-association-tracker gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
MetaPhat -meta-feno-associatie-tracker
PRODUCTBESCHRIJVING
MetaPhat is een actief en open source (MIT-licentie) hulpmiddel om varianten met multivariate associaties te detecteren door gebruik te maken van samenvattende statistieken uit univariate GWAS-onderzoeken. De applicatie voert ook ontleding uit door optimale BIC-subsets en P-waarde-driverkenmerken te vinden voor de multivariate leadvarianten. Varianteresultaten worden getraceerd en geclusterd om te helpen bij het ontleden van fenotypes-genotyperelaties.Zie onze wiki-homepagina voor installatie-instructies, vereiste GWAS-gegevensformaten en voorbeeldinvoer met testopdracht - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Gegevens over mondiale lipiden (GLGC, Willer 2013)/bron teervoorbeeld - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Als u problemen ondervindt of functieverzoeken heeft nadat u het voorbeeld hebt geprobeerd en de tutorial hebt gelezen, kunt u een e-mail sturen naar: [e-mail beveiligd]
Auteursrecht <2019> [e-mail beveiligd], [e-mail beveiligd]
Voordelen
- multivariate genoombrede kenmerkenanalyse
- p-waarde en op BIC gebaseerde selectie van optimale eigenschappensubsets
- trekontledingsspoorplots
- leidende SNP en samenvattingsbestand van bestuurderskenmerken
- snp-snp eigenschap rang speermancluster
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
