Dit is de Linux-app genaamd MOIRAI waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als moirai20140528.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd MOIRAI gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
MOIRAI
PRODUCTBESCHRIJVING
Cap-analyse van genexpressie (CAGE) is een op sequencing gebaseerde technologie om de 5'-uiteinden van RNA's in een biologisch monster te vangen. Na het in kaart brengen geeft een CAGE-piek op het genoom de positie van een actieve transcriptionele startplaats (TSS) aan en het aantal uitlezingen komt overeen met het expressieniveau ervan. CAGE wordt prominent gebruikt in zowel het FANTOM- als het ENCODE-project.
MOIRAI is een compact maar flexibel workflowsysteem dat is ontworpen om de belangrijkste stappen in gegevensverwerking en analyse van CAGE-gegevens uit te voeren. MOIRAI heeft een grafische interface waarmee wetlab-onderzoekers analyseworkflows kunnen maken, wijzigen en uitvoeren. In de workflows zijn grafische kwaliteitscontrole-indicatoren ingebed waarmee gebruikers de gegevenskwaliteit kunnen beoordelen en potentiële problemen snel kunnen opsporen. Het MOIRAI-pakket wordt geleverd met drie hoofdworkflows waarmee gebruikers meerdere samples in kaart kunnen brengen, annoteren en een uitdrukkingsanalyse kunnen uitvoeren.
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Perl, C, PHP, Java
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/moirai/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.