Dit is de Linux-app genaamd MoPAC waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als MoPAC_0.3.1.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam MoPAC gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
MoPAC
PRODUCTBESCHRIJVING
Om de vergelijking van essentiële genen in twee of meer celmonsters te vergemakkelijken, stellen we MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens) voor, een glanzend aangedreven interactief hulpmiddel voor differentiële essentialiteitsanalyse in CRISPR/Cas9-schermen.
Voor installatie- en gebruiksinstructies verwijzen wij u naar de wikipagina.
Kenmerken
- Onbevooroordeelde meting van differentiële gen-essentialiteit in CRISPR-schermen.
- Gebruiksgemak door een interactieve grafische gebruikersinterface.
- Cijfers die klaar zijn voor publicatie, worden bij elke stap van de analyse gegenereerd.
- Zowel FASTQ-bestanden als leestellingstabellen (voor of na normalisatie) zijn toegestaan als invoer.
- Op genencategorieën gebaseerde kwaliteitscontrole voor detectie en filtering van uitschieters.
- Genontologieanalyse ingebouwd via het STRINGdb R-pakket.
- Snelle verwerking door C++-compilatie van rekenintensieve stappen.
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Web-based
Programmeertaal
C++, S/R
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mopac/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
