Dit is de Linux-app genaamd pipasic waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als README.txt. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam pipasic gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
pipasisch
PRODUCTBESCHRIJVING
Metaproteomische analyse maakt het mogelijk om het samenspel van organismen of functionele groepen te bestuderen en is ook voor diagnostische doeleinden steeds populairder geworden. Er doen zich echter problemen voor vanwege de hoge sequentieovereenkomst tussen verwante organismen. Verder kan de staat van bewaring van eiwitten tussen soorten worden gecorreleerd met hun expressieniveau, wat kan leiden tot significante vertekening in resultaten en interpretatie. Deze uitdagingen zijn vergelijkbaar, maar niet identiek aan de uitdagingen die zich voordoen bij de analyse van metagenomische monsters en vereisen specifieke oplossingen.
pipasic (correctie van peptide-intensiteit-gewogen proteoom-overvloedovereenkomst) is een hulpmiddel dat op identificatie en spectrale telling gebaseerde kwantificatieresultaten corrigeert met behulp van schatting van peptide-overeenkomst en weging van expressieniveau binnen een niet-negatief lasso-raamwerk. pipasic heeft duidelijke voordelen ten opzichte van benaderingen die alleen betrekking hebben op unieke peptiden of het aggregeren van resultaten naar de laagste gemeenschappelijke voorouder.
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Python
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/pipasic/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
