Dit is de Linux-app genaamd Subread waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app genaamd Subread met OnWorks gratis online.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
Onderlees
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Het Subread-softwarepakket is een toolkit voor het verwerken van next-gen sequencinggegevens. Het bevat Subread aligner, Subjunc exon-exon junction detector en featureCounts leessamenvattingsprogramma.
Subread-aligner kan worden gebruikt om zowel gDNA-seq- als RNA-seq-lezingen uit te lijnen. Subjunc aligner werd gespecificeerd ontworpen voor de detectie van exon-exon junctie. Voor het in kaart brengen van RNA-seq-uitlezingen voert Subread lokale uitlijningen uit en Subjunc voert globale uitlijningen uit. Subread en Subjunc werden gepubliceerd in het volgende artikel: Yang Liao, Gordon K Smyth en Wei Shi. "De Subread-aligner: snelle, nauwkeurige en schaalbare leesmapping door seed-and-vote", Nucleic Acids Research, 2013, 41(10):e108
Kenmerken
- lees aligner
- sequentiëring van de volgende generatie
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
C
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/subread/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
