Dit is de Linux-app genaamd TagGraph waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als WindowsDockerTG.1.8.1.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik gratis deze app genaamd TagGraph met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
TagGraf
PRODUCTBESCHRIJVING
Hoewel massaspectrometrie zeer geschikt is voor het identificeren van duizenden potentiële eiwit post-translationele modificaties (PTM's), is het historisch gezien bevooroordeeld in de richting van slechts een paar. Om de volledige set PTM's over verschillende proteomen te meten, moet software de dubbele uitdaging overwinnen om enorme zoekruimten te bestrijken en juiste van onjuiste spectruminterpretaties te onderscheiden. Hier beschrijven we TagGraph, een rekentool die beide uitdagingen overwint met een onbeperkte, op tekenreeksen gebaseerde zoekmethode die maar liefst 350 keer sneller is dan bestaande benaderingen, en een probabilistisch validatiemodel dat we hebben geoptimaliseerd voor PTM-toewijzingen. We hebben TagGraph toegepast op een gepubliceerde menselijke proteomische dataset van 25 miljoen massaspectra en verdrievoudigde betrouwbare spectrumidentificaties in vergelijking met de oorspronkelijke analyse. We identificeerden duizenden wijzigingstypes op bijna 1 miljoen sites in het proteoom.Voordelen
- Complexe proteomen definiëren met string
Toehoorders
Onderwijs
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/taggraph/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
