Dit is de Linux-app genaamd UniPyRange die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als UniPyRangeSuite.py. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam UniPyRange online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
UniPyRange om online onder Linux te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
Zeer eenvoudig python-script dat u de pijn bespaart van het tellen van de aminozuren / DNA-basen in fasta-bestanden van de Uniprot en NCBI RefSeq Database (1, 2).Laten we zeggen dat je de aminozuursequentie van bereik 128-387 wilt van een eiwit van 1000 aminozuren - dit script zal je helpen om telfouten te voorkomen door je alleen de gespecificeerde sequentie in aminozuren en coderende DNA-basenparen te laten zien (ideaal voor amplificatieprimerontwerp ) van een opgegeven Uniprot-ID.
- Vereist BioPython (3) en Bioservices-pakket (4)
(1)
Het UniProt-consortium
UniProt: een hub voor eiwitinformatie
Nucleïnezuren Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: een update over referentiesequenties van zoogdieren. Nucleïnezuren Res. 2014 januari 1;42(1):D756-63.
(3)
Cock PJ et al. Bio-informatica (2009)
(4)
Cokelaer et al, Bio-informatica (2013)
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
