Dit is de Windows-app genaamd Alphafold waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Alphafoldv2.3.2.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app genaamd Alphafold met OnWorks gratis online.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
Alfafold
PRODUCTBESCHRIJVING
Dit pakket biedt een implementatie van de inferentiepijplijn van AlphaFold v2.0. Dit is een volledig nieuw model dat is ingevoerd in CASP14 en gepubliceerd in Nature. Voor de eenvoud noemen we dit model in de rest van dit document AlphaFold. Elke publicatie die bevindingen onthult die voortkomen uit het gebruik van deze broncode of de modelparameters, moet het AlphaFold-document citeren. Raadpleeg ook de aanvullende informatie voor een gedetailleerde beschrijving van de methode. U kunt een enigszins vereenvoudigde versie van AlphaFold gebruiken met deze Colab-notebook of door de gemeenschap ondersteunde versies. De totale downloadgrootte voor de volledige databases is ongeveer 415 GB en de totale grootte bij het uitpakken is 2.2 TB. Zorg ervoor dat u voldoende ruimte op de harde schijf, bandbreedte en downloadtijd heeft. We raden aan om een SSD te gebruiken voor betere genetische zoekprestaties.
Voordelen
- AlphaFold heeft meerdere genetische (sequentie)databases nodig om te kunnen draaien
- Hoewel de AlphaFold-code is gelicentieerd onder de Apache 2.0-licentie, worden de AlphaFold-parameters beschikbaar gesteld voor niet-commercieel gebruik
- 5 modellen die werden gebruikt tijdens CASP14 en die uitgebreid werden gevalideerd voor de kwaliteit van de structuurvoorspelling
- 5 pTM-modellen, die werden verfijnd om pTM . te produceren
- De eenvoudigste manier om AlphaFold uit te voeren, is door het meegeleverde Docker-script te gebruiken
- Standaard probeert Alphafold alle zichtbare GPU-apparaten te gebruiken
Programmeertaal
Python
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
