Dit is de Windows-app genaamd AutoDockParser waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als AutodockParser.exe. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd AutoDockParser gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
AutoDockParser
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
AutoDock Suit is een van de meest populaire software voor het uitvoeren van Molecular Docking en Virtual Screening. Dit pak biedt twee programma's AutoDock en AutoDock Vina. AutoDock levert zijn uitvoer als Docking Log Files (DLG-bestanden), terwijl de laatste wordt uitgevoerd in pdbqt-formaat.
De nabewerking van deze resultaten is lange tijd een handmatige taak gebleven en daarom zijn er verschillende protocollen en workflows ontworpen die gebruikersspecifiek zijn. Het handmatig verwerken van deze resultaten voor daaropvolgende interactieanalyse is een tijdrovende en ogenschijnlijk alledaagse taak gebleven. Handmatige verwerking brengt afhankelijkheid met zich mee van diverse externe software.
AutoDock Parser biedt automatische naverwerking van de dockingresultaten verkregen uit AutoDock Suit. AutoDock Parser is een gebruiksvriendelijke tool die bedoeld is om de inspanningen bij de naverwerking van dockingresultaten te minimaliseren. Het stelt de gebruiker in staat om in één stap eiwit-ligandcomplexen te creëren uit de ingevoerde DLG/PDBQT-bestanden.
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/autodockparser/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.