Dit is de Windows-app met de naam ChIP-RNA-seqPRO die in Windows online via Linux online moet worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als cloudclientID.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam ChIP-RNA-seqPRO online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
ChIP-RNA-seqPRO om in Windows online via Linux online te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
ChIP-RNA-seqPRO: een strategie voor het identificeren van regio's van epigenetische deregulering geassocieerd met afwijkende transcriptsplitsings- en RNA-bewerkingsplaatsen. Uitvoerbare Python-scripts, verpakt in aangepaste annotatiebibliotheken, demo-gegevensinvoer en README-gids.9/26: v1.1 MAIN_IV bijgewerkt om fouten te debuggen die worden gegenereerd door Python-panda's die 'subset' niet langer ondersteunen.
Deze code wordt hier niet langer actief onderhouden/bijgewerkt. Er is nu een cloudgebaseerde bron beschikbaar voor vergelijkende analyse van epigenetische, sequentievariatie- en expressiedatasets. Bezoek het Cloudomics, project voor cloudgebaseerde bronnen: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Kenmerken
- Hulpmiddel voor vergelijkende analyse van een breed scala aan epigenomische (ChIPseq, MBDseq, etc.) en op RNA gebaseerde sequencing-gepaarde monsterdatasets
- Als u deze tool of een van de annotatiebibliotheken gebruikt, voeg dan de volgende referentie toe: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. en H. Ho T. (2015). Bio-informaticastrategieën voor het identificeren van regio's van epigenetische deregulering die verband houden met afwijkende transcriptsplitsing en RNA-bewerking. In Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms, pagina's 163-170. DOI: 10.5220/0005248001630170
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Unix-shell, Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
