This is the Windows app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Download and run online this app named clusterProfiler with OnWorks for free.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
clusterProfiler
PRODUCTBESCHRIJVING
clusterProfiler is an R/Bioconductor package that provides a unified workflow for functional enrichment analysis to interpret high-throughput omics results. It supports both over-representation analysis and gene set enrichment analysis, letting you work with unranked gene lists or ranked statistics from differential pipelines. The package connects to multiple knowledge bases—such as Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH and others—through a consistent interface so you can query different biological lenses without rewriting code. It is designed for breadth, covering coding and non-coding features and thousands of organisms by leveraging continuously updated annotations. Results are returned in tidy, manipulation-friendly structures and pair naturally with rich visualization functions (via companion tooling) to summarize pathways, terms, and gene–set relationships.
Kenmerken
- Unified ORA and GSEA workflows across multiple annotation sources
- Broad species support using up-to-date gene annotations
- Tidy outputs that integrate cleanly with downstream R data pipelines
- Built-in visualization of enrichment results through companion plotting tools
- Multi-group comparison utilities (e.g., compareCluster) for cross-condition analysis
- Detailed vignettes and manuals for reproducible, end-to-end enrichment studies
Programmeertaal
R
Categorieën
This is an application that can also be fetched from https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. It has been hosted in OnWorks in order to be run online in an easiest way from one of our free Operative Systems.
