Dit is de Windows-app genaamd MAGeCK waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam MAGeCK gratis uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
MAGeCK
PRODUCTBESCHRIJVING
Modelgebaseerde analyse van genoombrede CRISPR-Cas9 Knockout (MAGeCK) is een computationeel hulpmiddel om belangrijke genen te identificeren uit de recente CRISPR-Cas9 knock-outschermtechnologie op genoomschaal.
Raadpleeg de wiki-pagina voor instructies en documentatie.
MAGeCK is ontwikkeld door Wei Li en Han Xu van het laboratorium van Dr. Xiaole Shirley Liu in het Dana-Farber Cancer Institute/Harvard School of Public Health, en wordt onderhouden door het Wei Li-lab in het Children's National Medical Center. We danken de steun van het Claudia Adams Barr-programma in innovatief basiskankeronderzoek en NIH/NHGRI om MAGeCK te ontwikkelen.
Kenmerken
- Het meest populaire computationele algoritme in screeninganalyse
- Meer dan 400 citaties en 60k downloads
- Eenvoudige, gebruiksvriendelijke pijplijn om genen te screenen in genoombrede CRISPR-Cas9 Knockout-experimenten
- Een complete documentatie met gemakkelijk te starten tutorials
- Hoge gevoeligheid en laag percentage valse ontdekkingen
- Actief onderhouden van de broncode met nieuwe functies en bugfixes
- Ondersteuning van de ontwikkelaars- en gebruikersgemeenschap
- Een reeks visualisatiefuncties die publicatiestandaardcijfers genereren
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Python, Californië
CATEGORIEËN
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mageck/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
