Dit is de Windows-app genaamd Scaffold_Builder waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als scaffold_builder_v2.2.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd Scaffold_Builder gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
Steiger_Bouwer
PRODUCTBESCHRIJVING
Scaffold_builder is software voor het bestellen van contigs die zijn gegenereerd door conceptsequencing langs een referentiesequentie. Hiaten worden opgevuld met N's en kleine overlappingen worden uitgelijnd met het Needleman-Wunsch-algoritme en de consensus gecreëerd met IUPAC-codes. Scaffold_builder kan helpen bij het samenstellen en annoteren van genomen door te onthullen wat er ontbreekt en gerichte sequencing mogelijk te maken om deze hiaten te dichten.(c) Silva GG, Dutilh BE, Matthews TD, Elkins K, Schmieder R, Dinsdale EA, Edwards RA.
Citeer alstublieft: "Combining de novo and reference-guided assembly with Scaffold_builder", Broncode voor Biologie en Geneeskunde 2013.
Voordelen
- steiger
- ontwerp-genoom
- bioinformatica
Gebruikersinterface
Webgebaseerd, opdrachtregel
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
