Jest to polecenie bowtie-inspect, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
bowtie-inspect - pobiera informacje z indeksu bowtie
STRESZCZENIE
przegląd muszek [Opcje]*
OPIS
nazwa pliku ebwt minus końcowe .1.ebwt/.2.ebwt
Domyślnie drukuje rekordy FASTA indeksowanych sekwencji nukleotydowych do standardu
na zewnątrz. Z -n, drukuje tylko nazwy. Z -s, po prostu drukuje podsumowanie indeksu
parametry i sekwencje. Z -e, w stosownych przypadkach zachowuje kolory.
OPCJE
--duży-indeks
wymusza kontrolę „dużego” indeksu, nawet jeśli obecny jest „mały”.
-a/--przez
Liczba znaków w poprzek na wyjściu FASTA (domyślnie: 60)
-n/--nazwy
Wydrukuj tylko nazwy sekwencji referencyjnych
-s/--streszczenie
Wydrukuj podsumowanie, w tym nazwy odnośników, długości, właściwości indeksu
-e/--ebwt-ref
Zrekonstruuj odniesienie z ebwt (powoli, zachowuje kolory)
-v/--gadatliwy
Szczegółowe dane wyjściowe (do debugowania)
-h/--Wsparcie
wydrukuj szczegółowy opis narzędzia i jego opcji
--help wydrukuj tę wiadomość o użytkowaniu
64-bitowy Zbudowany na lgw01-11 Thu Nov 26 11:13:31 UTC 2015 Kompilator: wersja gcc 5.2.1 20151123
(Ubuntu 5.2.1-25ubuntu1) Opcje: -O3 -Wł,--styl-hash=oba -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2
-fstack-protector-silny -Wformat -Błąd=format-zabezpieczenia -g -O2 -fstack-protector-silny
-Wformat -Błąd=format-zabezpieczenia -Wł,-Bsymboliczne-funkcje -Wł,-z,relro Sizeof {int, długi,
długi długi, pusty*, rozmiar_t, wyłączony_t}: {4, 8, 8, 8, 8, 8}
Korzystaj z usługi bowtie-inspect online, korzystając z usług onworks.net
