Jest to polecenie cmtk-dwi_mask_bad_slices, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online systemu Mac OS
PROGRAM:
IMIĘ
dwi_mask_bad_slices - Znajdź złe plasterki w zestawie obrazów ważonych dyfuzją.
STRESZCZENIE
dwi_mask_bad_slices Ścieżki obrazu dyfuzji
OPIS
To narzędzie odczytuje zestaw obrazów MR 3D ważonych dyfuzją i znajduje złe plasterki. Zły kawałek
w obrazie dyfuzyjnym jest wykrywany jako taki, którego średnie natężenie jest poza określonym
przedział wokół średniej ze wszystkich odpowiednich przekrojów z pozostałych
obrazy dyfuzyjne.
OPCJE
Globalne Toolkit Opcje (te jest shared by cała kolekcja CMTK narzędzia)
--help
Zapisz listę podstawowych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.
--Pomóż wszystkim
Napisz pełną listę podstawowych i zaawansowanych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.
--wiki
Zapisz listę opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście w znacznikach MediaWiki.
--facet
Zapisz źródło strony podręcznika w znaczniku 'nroff' na standardowe wyjście.
--wersja
Zapisz wersję zestawu narzędzi na standardowe wyjście.
--Echo
Zapisz bieżącą linię poleceń na standardowe wyjście.
--pełny-poziom
Ustaw poziom szczegółowości.
--gadatliwy, -v
Zwiększ poziom szczegółowości o 1 (przestarzałe; obsługiwane w celu zapewnienia zgodności z poprzednimi wersjami).
--wątki
Ustaw maksymalną liczbę równoległych wątków (dla wątków POSIX i OpenMP).
Wkład Opcje
--b0liczba
Liczba obrazów b=0 na początku listy obrazów. Nie są one uwzględnione w
wykrywanie lub maskowanie złych wycinków, ale są również zapisywane w katalogu wyjściowym dla
wygoda. Zakłada się, że wszystkie obrazy b=0 znajdują się na początku listy
obrazy wejściowe, ale nie na końcu ani w środku. [Domyślny: 0]
--orientacja na plasterki
Zdefiniuj orientację plasterka obrazów dyfuzji. Obsługiwane wartości: „osiowe”,
„strzałkowy”, „koronowy”, „slice-x”, „slice-y”, „slice-z”, gdzie domyślnie jest „osiowy”,
lub użyj jednego z poniższych:
--osiowy
Plastry osiowe [To is dotychczasowy domyślny]
--strzałkowy
Plastry strzałkowe
--koronalny
Plastry koronalne
--wycinek-x
Oś współrzędnych X to kierunek wycinka
--plaster-y
Oś współrzędnych Y to kierunek wycinka
--wycinek-z
Oś współrzędnych Z to kierunek wycinka [To is dotychczasowy domyślny]
Łazienka Plaster Wykrywanie
--odchylenie standardowe
Próg dla identyfikacji złego wycinka w jednostkach intensywności odchylenia standardowe powyżej
wszystkie odpowiadające wycinki z pozostałych obrazów dyfuzji. [Domyślny: 3]
Wydajność Opcje
--Konwertuj na
Skalarny typ danych dla obrazów wyjściowych. Jeśli twoja wartość dopełnienia jest ujemna, ale twoje
wprowadź dane bez znaku, na przykład upewnij się, że wybrałeś podpisany typ danych dla
wyjście. Domyślnie typ danych wyjściowych jest taki sam jak typ wejściowy. Utrzymany
wartości: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" lub użyj
jeden z następujących:
--zwęglać
8 bitów, sygnowany
--bajt
8 bitów, bez znaku
--niski
16 bitów, sygnowany
--skrót
16 bitów, bez znaku
--int
32 bity podpisane
--uint
32 bity bez znaku
--pływak
32 bity zmiennoprzecinkowe
--podwójnie
64 bity zmiennoprzecinkowe
--wartość-dopełnienia , -p
Wartość dopełnienia zastępująca dane wykrytych uszkodzonych plasterków w obrazach wyjściowych. [Domyślny: -jeden]
--katalog wyjściowy , -o
Ścieżka systemu plików do zapisywania obrazów z zamaskowanymi złymi plasterkami (tj. wypełnionymi
wartość dopełnienia). [Domyślny: ŻADEN]
AUTORSKI
Torsten Rohlfing, z udziałem Michaela P. Hasaka, Grega Jefferisa, Calvina R.
Maurer, Daniel B. Russakoff i Jarosław Halchenko
Użyj cmtk-dwi_mask_bad_slices online za pomocą usług onworks.net
