Rejestracja cmtk - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

rejestracja - Rejestracja sztywna i afiniczna

STRESZCZENIE

rejestracja Obraz referencyjny Obraz pływający

OPIS

Program ten wykonuje sztywną i afiniczną rejestrację obrazu przy użyciu wielu rozdzielczości
optymalizacja miar podobieństwa obrazów opartych na wokselach.

OPCJE

Globalne Toolkit Opcje (te jest shared by cała kolekcja CMTK narzędzia)
--help
Zapisz listę podstawowych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.

--Pomóż wszystkim
Napisz pełną listę podstawowych i zaawansowanych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.

--wiki
Zapisz listę opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście w znacznikach MediaWiki.

--facet
Zapisz źródło strony podręcznika w znaczniku 'nroff' na standardowe wyjście.

--xml
Napisz specyfikację składni wiersza poleceń w znacznikach XML (w celu integracji z Slicerem).

--wersja
Zapisz wersję zestawu narzędzi na standardowe wyjście.

--Echo
Zapisz bieżącą linię poleceń na standardowe wyjście.

--pełny-poziom
Ustaw poziom szczegółowości.

--gadatliwy, -v
Zwiększ poziom szczegółowości o 1 (przestarzałe; obsługiwane w celu zapewnienia zgodności z poprzednimi wersjami).

--wątki
Ustaw maksymalną liczbę równoległych wątków (dla wątków POSIX i OpenMP).

Automatyzacja Opcje
--automatyczne wielopoziomowe
Automatyczna optymalizacja i generowanie parametrów rozdzielczości dla poziomy [Domyślny:
0]

Optymalizacja w panelu ustawień
--badanie , -e
Eksploracja [początkowy rozmiar kroku optymalizatora] [Domyślny: 8]

--precyzja , -a
Dokładność [końcowy rozmiar kroku optymalizatora] [Domyślny: 0.1]

--współczynnik kroku , -f
Współczynnik zmniejszania rozmiaru kroku wyszukiwania. Musi wynosić > 0.0 i < 1.0 [Domyślny: 0.5]

--delta-f-próg
Opcjonalny próg zakończenia optymalizacji (poziomu) w przypadku względnej zmiany celu
funkcja spada poniżej tej wartości. [Domyślny: 0]

Obraz rozkład parametry
--próbowanie , -s
Próbkowanie obrazu (najlepsza rozdzielczość ponownie próbkowanego obrazu) [Domyślny: 1]

--najgrubszy
Górna granica próbkowania obrazu w hierarchii wielorozdzielczej [Domyślny: -jeden]

--pomiń-oryginalne-dane
Nie używaj oryginalnych danych w pełnej rozdzielczości, pomiń końcowy etap w wielorozdzielczości
hierarchii, co skraca czas obliczeń.

Transformacja parametry
--dofy [, ,...]
Dodaj liczbę stopni swobody [można powtórzyć]

--dofs-final [, ,...]
Dodaj liczbę stopni swobody tylko dla poziomu końcowego [można powtórzyć]

--bez przełącznika, -n
Nie przełączaj automatycznie obrazu odniesienia i obrazu ruchomego w celu poprawy obliczeń
jest gwarancją najlepszej jakości, które mogą dostarczyć Ci Twoje monitory,

--initxlate, -i
Zainicjowana transformacja poprzez przełożenie środka FOV pływającego obrazu na punkt odniesienia
obraz centrum FOV

--Inicjał
Zainicjuj transformację z podanej ścieżki [Domyślny: ŻADEN]

--początkowy-jest-odwrotny
Odwróć początkową transformację przed zainicjowaniem rejestracji

Obraz dane
--rejestracja-metryka
Metryka rejestracji do estymacji ruchu przez rejestrację obrazu na obraz. Utrzymany
wartości: „nmi”, „mi”, „cr”, „msd”, „ncc”, gdzie wartością domyślną jest „nmi”, lub użyj jednego z
następujące brzmienie:

--nmi
Znormalizowana metryka informacji wzajemnych [To is dotychczasowy domyślny]

--mi Standardowa metryka informacji wzajemnych

--kr Metryka współczynnika korelacji

--msd
Metryka średniej kwadratowej różnicy

--ncc
Znormalizowana metryka korelacji krzyżowej

--histogramy dopasowania
Dopasuj pływający histogram obrazu do histogramu obrazu odniesienia.

Numer Referencyjny Obraz Przetwarzanie wstępne
--klasa-ref
Klasa danych: szary (domyślny) lub etykieta [Domyślny: ŻADEN]

--pad-ref
Wartość dopełnienia [Domyślny: wyłączone]

--thresh-min-ref
Minimalny próg obcięcia wartości [Domyślny: wyłączone]

--thresh-max-ref
Próg obcięcia wartości maksymalnej [Domyślny: wyłączone]

--prune-histogram-ref
Liczba pojemników do przycinania na podstawie histogramu [Domyślny: wyłączone]

--histogram-wyrównanie-ref
Zastosuj wyrównanie histogramu

--sobel-filter-ref
Zastosuj filtr wykrywania krawędzi Sobela

--crop-index-ref
Region kadrowania we współrzędnych indeksu pikseli [przeanalizowany jako %d,%d,%d,%d,%d,%d dla
i0,j0,k0,i1,j1,k1] [Domyślny: ŻADEN]

--crop-world-ref
Region kadrowania we współrzędnych świata [przeanalizowany jako %f,%f,%f,%f,%f,%f dla
x0,y0,z0,x1,y1,z1] [Domyślny: ŻADEN]

Pływające Obraz Przetwarzanie wstępne
--class-flt
Klasa danych: szary (domyślny) lub etykieta [Domyślny: ŻADEN]

--pad-flt
Wartość dopełnienia [Domyślny: wyłączone]

--thresh-min-flt
Minimalny próg obcięcia wartości [Domyślny: wyłączone]

--thresh-max-flt
Próg obcięcia wartości maksymalnej [Domyślny: wyłączone]

--prune-histogram-flt
Liczba pojemników do przycinania na podstawie histogramu [Domyślny: wyłączone]

--histogram-wyrównanie-flt
Zastosuj wyrównanie histogramu

--sobel-filter-flt
Zastosuj filtr wykrywania krawędzi Sobela

--crop-index-flt
Region kadrowania we współrzędnych indeksu pikseli [przeanalizowany jako %d,%d,%d,%d,%d,%d dla
i0,j0,k0,i1,j1,k1] [Domyślny: ŻADEN]

--crop-world-flt
Region kadrowania we współrzędnych świata [przeanalizowany jako %f,%f,%f,%f,%f,%f dla
x0,y0,z0,x1,y1,z1] [Domyślny: ŻADEN]

Wydajność parametry
--lista zewnętrzna , -o
Ścieżka wyjściowa do ostatecznej transformacji [Domyślny: ŻADEN]

--out-macierz
Ścieżka wyjściowa dla ostatecznej transformacji w formacie macierzowym [Domyślny: ŻADEN]

--out-parametry
Ścieżka wyjściowa dla ostatecznej transformacji w formacie zwykłej listy parametrów [Domyślny: ŻADEN]

--protokół , -p
Nazwa pliku wyjściowego protokołu optymalizacji [Domyślny: ŻADEN]

--czas , -t
Nazwa pliku wyjściowego statystyki czasu obliczeń [Domyślny: ŻADEN]

import Efekt najnowszych Krajalnica
--out-itk
Ścieżka wyjściowa do ostatecznej transformacji w formacie ITK [Domyślny: ŻADEN]

--write-przeformatowany
Napisz ponownie sformatowany pływający obraz. [Domyślny: ŻADEN]

Obraz/Transformacja Baza danych
--db.
Ścieżka do bazy danych obrazu/transformacji, która powinna zostać zaktualizowana o nową
rejestracji i/lub przeformatowanego obrazu. [Domyślny: ŻADEN]

AUTORSKI

Torsten Rohlfing, z udziałem Michaela P. Hasaka, Grega Jefferisa, Calvina R.
Maurer, Daniel B. Russakoff i Jarosław Halchenko

Skorzystaj z rejestracji cmtk online, korzystając z usług onworks.net