Jest to polecenie dbifastae, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
dbifasta - Indeksuj bazę danych plików fasta
STRESZCZENIE
dbifasta -nazwa_bazy ciąg -identyfikator formatu podstęp -informator katalog -nazwy plików ciąg
-uwolnienie ciąg -data ciąg -pola podstęp -wykluczać ciąg -maxindeks liczba całkowita
-sortowanie ciąg sortowanie systemowe boolean -sprzątać boolean -plik wyjściowy plik wyjściowy
-indeks katalog zewnętrzny przewyższyć
dbifasta -Pomoc
OPIS
dbifasta to program wiersza poleceń firmy EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Pakiet oprogramowania"). Jest to część grup poleceń „Utils:Database indexing”.
OPCJE
Wkład Sekcja
-nazwa_bazy ciąg
-identyfikator formatu podstęp
Wartość domyślna: idacc
-informator katalog
Domyślna wartość: .
-nazwy plików ciąg
Wartość domyślna: *.dat
Wymagane Sekcja
-uwolnienie ciąg
Wartość domyślna: 0.0
-data ciąg
Wartość domyślna: 00/00/00
Zaawansowane Sekcja
-pola podstęp
Wartość domyślna: wg
-wykluczać ciąg
-maxindeks liczba całkowita
-sortowanie ciąg
Opcje sortowania, zazwyczaj „-T”. aby użyć bieżącego katalogu dla plików roboczych i „-k 1,1” do
wymusza użycie przez GNU sort pierwszego pola Wartość domyślna: -T . -k 1,1
sortowanie systemowe boolean
Wartość domyślna: Y
-sprzątać boolean
Wartość domyślna: Y
Wydajność Sekcja
-plik wyjściowy plik wyjściowy
-indeks katalog zewnętrzny przewyższyć
Domyślna wartość: .
Korzystaj z dbifastae online, korzystając z usług onworks.net
