Jest to polecenie ecogrep, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
ecogrep - filtrowanie wyniku ecoPCR na podstawie filtra identyfikatora taksonomicznego i wyrażenia regularnego
wzorzec
STRESZCZENIE
ekogrep [opcje] filename
OPIS
ecoPCR to elektroniczne oprogramowanie PCR opracowane przez firmy LECA i Helix-Project. Pomaga
oszacować jakość starterów kodów kreskowych.
Ten program należy do pakietu exoPCR.
OPCJE
-1 : [PIERWSZY] : porównaj podany wzór z oligonukleotydem o bezpośredniej nici
-2 : [DRUGI] : porównaj podany wzór z oligonukleotydem o odwrotnej nici
-d : [D]baza danych zawierająca informacje taksonomiczne
-e : [E]rrors : maksymalny dozwolony błąd w dopasowaniu wzorca (opcja-1, -2 i -p) (0 wg
domyślna)
-p : [P]wzór: wzór oligonukleotydowy
-h : [H]elp: drukuj pomoc
-i : [I] ignoruję poddrzewo w ramach danego identyfikatora taksonomicznego
-r : [R]ogranicz wyszukiwanie do poddrzewa o podanym identyfikatorze taksomicznym
-v : w [V]ert sens dopasowania, aby wybrać niepasujące linie.
Argument:
Nazwa pliku wyjściowego ecoPCR
Korzystaj z ecogrep online, korzystając z usług onworks.net
