Jest to polecenie fsl, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu Mac OS
PROGRAM:
IMIĘ
fsl - narzędzia analityczne do obrazowania mózgu FMRI, MRI i DTI
OPIS
FSL to kompleksowy zestaw narzędzi do analizy danych z medycznego obrazowania mózgu. Ono
udostępnia narzędzia do wstępnego przetwarzania danych, ekstrakcji mózgu, rejestracji obrazu, a także
szerokie spektrum analiz statystycznych. FSL zapewnia łatwy w użyciu graficzny interfejs użytkownika.
FSL wymaga prawidłowego ustawienia wielu zmiennych środowiskowych. Osiągnąć to,
proszę zaczerpnąć skrypt konfiguracyjny z /etc/fsl/5.0/fsl.sh. Jeden sposób na zrobienie tego
automatycznie jest dodanie linii zawierającej
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
do pliku .bashrc w katalogu domowym użytkownika (lub odpowiedniego pliku dla innych powłok)
niż bash). Może być konieczne wcześniejsze utworzenie takiego pliku.
Alternatywnie, pakiet Debian instaluje dowiązania symboliczne dla wszystkich narzędzi FSL w / usr / bin że
zadbaj o automatyczne wczytanie odpowiedniej konfiguracji. Nazwy dowiązań symbolicznych to
poprzedzone odpowiednim FSL wersja, aby zapobiec konfliktom nazw plików i zezwolić
wiele wersji współistniejących w tym samym systemie. Na przykład krajalnica polecenie jest
dostępny jako krajalnica fsl5.0. Należy pamiętać, że do używania FSL narzędzia za pośrednictwem tych dowiązań symbolicznych, to jest
nie niezbędne do wykonania procedury konfiguracji opisanej powyżej. Jednak ta wygoda
funkcja jest specyficzna dla Debiana. Skrypty wykorzystujące polecenia FSL i przeznaczone do udostępniania
z innymi powinny polegać na nazwach poleceń bez prefiksów i zmiennej środowiskowej FSL
Ustawiać.
Połączenia FSL interfejs użytkownika czasami odnosi się do FSLDIR. W systemach Debiana jest to
/usr/share/fsl/5.0 dla wersji FSL 5.0.
FSL dokumentację i pomoc online zapewnia fsl-5.0-doc pakiet.
Pytania dotyczące korzystania z FSL lub pokrewną teorię można opublikować na FSL pocztowy
podstęp (Patrz http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
PARALELIZACJA
FSL można skonfigurować do przesyłania zadań do działającego Sun Gridengine (SGE). Chociaż nie wszystkie
funkcjonalność zaimplementowana w FSL wspiera ten rodzaj zrównoleglenia, najbardziej wymagający
narzędzia do przetwarzania (np. POSSUM i FDT).
FSL powinien mieć możliwość korzystania z SGE, nawet jeśli zmienna środowiskowa SGE_ROOT nie jest ustawiona, jak w
przypadek pakietu Debiana firmy SGE. Aby włączyć przetwarzanie wsadowe, po prostu ustaw
FSLRÓWNOLEGŁY=1
w powłoce, w której działa FSL. Można to włączyć na stałe w
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
lub indywidualnie dla każdego przypadku.
Korzystaj z fsl online za pomocą usług onworks.net
