To jest polecenie gt-gff3validator, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
gt-gff3validator - Ściśle sprawdza poprawność podanych plików GFF3.
STRESZCZENIE
gt walidator gff3 [opcja...] [plik_GFF3...]
OPIS
-sprawdzanie typu [ciąg]
użyj ontologii podanej w pliku OBO, aby zweryfikować relacje rodzic-dziecko. Jeśli nie
podany jest argument, używany jest plik sofa.obo z katalogu gtdata/obo_files. Jeśli
podany jest argument, jest on używany jako nazwa pliku OBO. W przypadku, gdy taki plik ma
nie istnieje .obo jest dodawany do argumentu i ładuje wynikową nazwę pliku z
próbowano utworzyć katalog gtdata/obo_files. (domyślnie: nieokreślony)
-xrfcheck [ciąg]
sprawdź atrybuty Dbxref i Ontology_term pod kątem poprawnej składni zgodnie z a
plik definicji skrótu. Jeśli nie podano żadnego argumentu, plik GO.xrf_abbs z
używany jest katalog gtdata/xrf_abbr. Jeśli podano argument, jest on używany jako konkretny
nazwa pliku dla pliku skrótu. W przypadku, gdy taki plik nie istnieje,
.xrf_skr jest dodawany do argumentu i ładuje wynikową nazwę pliku z
Podjęto próbę przeniesienia katalogu gtdata/xrf_abbr. (domyślnie: nieokreślony)
-Pomoc
wyświetl pomoc i wyjdź
-wersja
wyświetl informacje o wersji i wyjdź
RAPORTOWANIE ROBAKI
Zgłoś błędy do[email chroniony]>.
Korzystaj z gt-gff3validator online, korzystając z usług onworks.net
