Jest to polecenie hmm-assembler.pl, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
hmm-assembler.pl - moduł SNAP hmm-assembler.pl
STRESZCZENIE
hmm-assembler.pl [-OPCJE [-WIĘCEJ MOŻLIWOŚCI]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
OPCJE
Połączenia następujący jednoznakowy Opcje jest przyjęty:
Z argumentami: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Wartość logiczna (bez argumentów): -r -o -x -p -t -1
Opcje mogą być łączone. -- zatrzymuje przetwarzanie opcji. Miejsce nie jest wymagane
pomiędzy opcjami i ich argumentami.
Opcje:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] obejmuje model 3'UTR, wymaga -a
-a [] obejmuje model PolyA, wymaga -3
-5 [] obejmuje moel 5'UTR, wymaga -p
-p wymaga uwzględnienia ogólnego modelu promotora -5
-r uwzględnij ogólny model powtórzeń
-o uwzględnić odwrócony model ORF
-x użyj jawnego modelu intronu czasu trwania
-t wymaga transsplicingu C.elegans -p, -5
-Z ustawia wartości specyficzne dla kladu (robak, mucha, roślina)
-1 model pojedynczego genu
-c
obejmują model dawcy splotu GC-AG
Korzystaj z hmm-assembler.pl online, korzystając z usług onworks.net