Jest to polecenie khmer, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
Khmer - liczenie k-merów, filtrowanie i przeglądanie wykresów FTW!
khmer to biblioteka i zestaw narzędzi do wykonywania analiz i transformacji zbiorów danych opartych na k-merach
STRESZCZENIE
Khmer [opcje] args
na przykład.
Khmer ładowanie do liczenia -x 1e8 -k 20 odczyty.ct odczyty.fa.gz
ZASTOSOWANIE
Ta strona podręcznika opisuje tylko Khmer skrypt opakowania. Aby dowiedzieć się więcej o oprogramowaniu i
jak go używać, zobacz /usr/share/doc/khmer lub inny http://khmer.readthedocs.org/.
W Debianie/Ubuntu opiekunowie pakietów unikają bezpośredniego umieszczania dużych zbiorów skryptów
do ŚCIEŻKI systemowej. Zamiast tego do uruchomienia skryptu używany jest pojedynczy skrypt opakowujący
chcesz użyć; dlatego jeśli instrukcje khmerskie mówią, żeby uciekać load-in-counting.py
...cokolwiek... musisz poprzedzić to polecenie przedrostkiem Khmer. Ponadto rozszerzenie .py
można pominąć, w wyniku czego otrzymamy polecenie w formacie pokazanym powyżej.
Jeśli ci się to nie podoba, po prostu dodaj /usr/lib/khmer/bin do swojej osobistej PATH.
Korzystaj z khmerskiego online, korzystając z usług onworks.net
