To jest polecenie loadingPulses, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
LoadPulses - informacje o impulsie sekwencjonowania obciążenia
STRESZCZENIE
obciążenieImpulsy podstawowaNazwaPliku cmpNazwaPliku [Opcje]
OPIS
obciążenieImpulsy ładuje informacje o impulsach sekwencyjnych, takie jak odległość lub jakość między impulsami
informacje do pliku cmp.h5. Pozwala to na analizę kinetyki i jakości
informacje według kolumny wyrównania.
OPCJE
podstawowaNazwaPliku
Wejście {bas,pls}.h5 lub wejście.fofn.
cmpNazwaPliku
Plik cmp.h5, do którego należy załadować informacje o pulsie.
-metryka wartość
Lista danych rozdzielonych przecinkami (bez spacji).
Prawidłowe opcje to:
WhenStarted, QualityValue, InsertionQV, MergeQV, DeletionQV, DeletionTag,
SubstitutionTag, SubstitutionQV, PreBaseFrames, IPD, StartFrame, PulseWidth,
SzerokośćInFrames, Światło, pkmid, ClassifierQV, PulseIndex
Domyślne opcje to:
QualityValue, ClassifierQV, StartFrame, PulseWidth, SzerokośćInFrames, pkmid,
IPD
-failOnBrakująceDane
Wyjdź, jeśli brakuje jakichkolwiek pól danych na wejściu bas.h5 lub pls.h5
wymagane do załadowania metryki. Wartość domyślna to ostrzeżenie.
-przeczytane
Ładuj informacje o impulsach poprzez odczyt, a nie poprzez buforowanie metryk.
-bymetryczny
Załaduj informacje o pulsie według metryki, a nie odczytu. Zużywa to więcej pamięci niż
-przeczytane, ale może być szybciej.
-maxElementy wartość
Ustaw limit rozmiaru pliku pls/bas, który ma być buforowany -bymetryczny (domyślna wartość:
maksymalna int). Używać -przeczytane jeśli limit zostanie przekroczony.
-max Pamięć wartość
Ustaw limit (w GB) pamięci, w której chcesz buforować dane -bymetryczny (wartość domyślna: 4
GB). Używać -przeczytane jeśli limit zostanie przekroczony.
-metaNElementy wartość
Ustaw liczbę elementów w pamięci podręcznej metadanych do odczytu pliku bas/bax/pls.h5.
-surowe elementywartość
Ustaw liczbę elementów w pamięci podręcznej danych surowych do odczytu pliku bas/bax/pls.h5.
-rawRozmiar kawałka wartość
Ustaw rozmiar fragmentu pamięci podręcznej surowych danych do odczytu pliku bas/bax/pls.h5.
Korzystaj z funkcji LoadPulses online, korzystając z usług onworks.net
