Jest to polecenie mapMers-depth, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
mapMers-depth - raportuje informacje o mapowaniu kmerów do sekwencji
STRESZCZENIE
mapMers-głębokość {-liczyć|-głębokość|-statystyki} -merowie MERYL -m WIELKOŚĆ -nast IN.FAST
OPCJE
Tryby pracy of działanie
Dla kolejności porządkowej „s” i pozycji w tym ciągu „p”:
-liczyć raportuje liczbę (c) pojedynczego kilometra, który zaczyna się w pozycji (p).
Format: 'spc'
-głębokość zgłasza liczbę (n) kmerów, które obejmują pozycję (p).
Format: 'spn'
-statystyki podaje minimalną (m), maksymalną (M) i średnią (a) liczbę wszystkich merów, które obejmują
pozycja (p). zgłasza również całkowitą liczbę (t) i liczbę kmerów (n)
Format: 'spm M atn'
Ogólne
-m WIELKOŚĆ
-merowie MERYL
Meryl(1) baza danych
-nast IN.FAST
szybka sekwencja wejściowa
Korzystaj z mapMers-depth online za pomocą usług onworks.net