medcon - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

medcon - MedCon konwersja formatów obrazów medycznych

STRESZCZENIE

lekarz [opcje] -f pliki ...

OPIS

MedCon to narzędzie do konwersji przeznaczone do zrekonstruowanych jądrowych obrazów medycznych.

Obsługiwane formaty to:

Notacja wyjaśniająca format
------ ---------- --------
Ascii Raw tablice obrazów ascii bez nagłówka „ascii”
Binarne tablice obrazów binarnych Raw bez nagłówka „bin”
Gif89a animowany GIF z mapą kolorów „gif”
Acr/Nema Papyrus, Siemens (wersja 2.0) „acr”
Format lokalny INW RUG (wersja 1.0) „inw”
ECAT Siemens CTI ECAT 6 'ecat6' lub 'ecat'
ECAT Siemens CTI ECAT 7 'ecat7'
InterFile wersja 3.3 'intf'
Analizuj z uwzględnieniem oprogramowania SPM „anlz”
DICOM wykorzystuje bibliotekę VT-DICOM „dicom”
Przenośna grafika sieciowa PNG „png”
Concorde Concorde/microPET 'stęż.'
NIfTI Neuroobrazowanie Inicjatywa informatyczna „nifti”

FLAGI

-F, --plik, --pliki ...
Przeczytaj listę plików.

OPCJE

-8, --indeksowany-kolor
Ten tryb kolorów wymusza redukcję 24-bitowych kolorowych obrazów RGB do 8-bitowych obrazów indeksowanych
mapa kolorów. Aby uzyskać informacje na temat redukcji kolorów w połączeniu z ditheringiem, patrz opcja -dith.

-24, --prawdziwy kolor
Ten tryb koloru zachowuje 24-bitowy obraz bez zmian.

-Alias, --nazywanie aliasów
Generuj nazwy plików na podstawie informacji o pacjencie i badaniu. Składnia
wynikowa nazwa bazowa to:

+ + +
i
+ +

z trzema ostatnimi identyfikatorami stosowanymi w przypadku, gdy formatem źródłowym jest DICOM lub
Akr/Nema. Zobacz także -noprefix. Ponieważ Analyze nie ma nazwy pacjenta,
Zamiast tego używany jest identyfikator_pacjenta.

-zaraz, --anonimowy
Anonimowe wpisy dotyczące pacjentów i badań (wypełnione znakiem „X”). Ta opcja może
nie należy używać z opcją -ident.

-b8, --unsigned-char

-b16, --podpisany-krótki

-b16.12
Wymuś zapis pikseli Uint8 lub Int16. Opcja specjalna -b16.12 używa tylko 12
bitów, jednak bez znaku. Dzięki tym opcjom można stracić określony ilościowo pływak
wartości, gdy nowy format nie obsługuje globalnego współczynnika przeskalowania lub
nachylenie/przecięcie.

-duża, --big-endian
Wymuś zapisywanie plików big endian, jeśli jest to obsługiwane przez format.

-ramka boczna, --sortuj według ramki
Ustaw kolejność sortowania w ECAT według ramek, zamiast domyślnego sortowania anatomicznego (opartego na
położenie plasterka). Identyczne płaszczyzny w każdej klatce zostaną zgrupowane razem. ty nie
chcę to.

-C, --konwertować ...
Konwertuj z listą formatów do konwersji. Użyj notacji bez cudzysłowów jako
podane w powyższej tabeli. Nie możesz użyć tej opcji z opcją -p.

-kontrast, --włącz kontrast
Zastosuj (DICOM) mapowanie kontrastu środka/szerokości okna. Chociaż może to poprawić
wyświetlanie obrazów, dowolne niezależne od producenta wartości pikseli (np. HU, SUV) z
opcje oznaczania ilościowego -qc lub -qs zostaną utracone.

-kor, --koronalny
Pokrój obrazy objętości na projekcję koronalną, zachowując rzeczywistość
wymiary świata.

-przyciąć= : : : , --crop-images= : : :
Ta opcja pozwala przyciąć równą klatkę ze wszystkich obrazów w : Gdzie
szerokość i wysokość są : . Lewy górny róg obrazu to 0:0.

-cs, --sortowanie-cine
Zastosuj sortowanie filmów, 1. obraz w każdym przedziale czasowym, 2. obraz w każdym przedziale czasowym, 3
obraz każdego przedziału czasowego, ... (dotyczy bramkowanego SPECT). Ponowne zastosowanie NIE powoduje cofnięcia
to sortowanie. Do tego potrzebna jest opcja -cu.

-cu, --cine-cofnij
Cofnij sortowanie cine (w wyniku opcji -cs).

-cw= :
Odwzoruj kontrast przy użyciu określonej pary środek/szerokość. Żadne spacje nie są dozwolone w tym
opcja. Zobacz także opcje kontrastu.

-D, --odpluskwić
Pokaż informacje o debugowaniu. Po odczytaniu pliku program wyświetli zawartość pliku
wewnętrzna struktura FILEINFO.

-db Drukuj tylko nagłówek główny plików CTI ECAT na standardowe wyjście.

-dith, --dither-kolor
Użyj ditheringu, aby poprawić jakość redukcji kolorów (od RGB do 8-bitowego indeksu).

-mi, --wyciąg [obraz zakresy ...]
Procedura interaktywnego wyodrębniania obrazów, chyba że określisz normalny styl obrazu
zakresy bezpośrednio w linii poleceń oddzielone spacjami. W normalnym stylu też
możliwość zmiany kolejności obrazów. Musisz określić wyjście
format konwersji (patrz opcja -c). Zauważ, że ekstrakcja NIE dodaje pliku
separacje plasterków środek-środek. Innymi słowy, właściwe pomiary objętości mogą
zgubić się.

Rodzaj wyboru? 1=normalny 2=ekot

Normalny styl
------------

- Każda liczba musi opierać się na jedynkach (0 = wszystkie odwrócone)
- Składnia zakresu : X...Y lub XY
- Składnia interwału: X:S:Y (S = krok)
- Lista jest wrażliwa na sekwencje!

Podaj listę obrazów do wyodrębnienia?

Styl Ecata
----------

- Dowolna liczba musi opierać się na jedynkach (0 = wszystkie)
- Składnia zakresu : X...Y lub XY
- Składnia interwału: X:S:Y (S = krok)

Podaj listę samolotów?
Podaj listę ramek?
Podaj listę bramek?
Podaj listę łóżek?

-ean, --echo-alias-nazwa
Wygodna funkcja, która szybko odtwarza alias lub czytelną dla człowieka nazwę pliku
ekranie, bez żadnych opóźnień w przetwarzaniu obrazu. Dla składni tego aliasu
nazwa pliku, patrz opcja -alias. Dane wyjściowe można następnie wykorzystać na przykład w skrypcie
aby tworzyć interpretowalne łącza do plików o tajemniczych numerach wynikających z DICOM
series.

-fb-brak, --bez-powrotu

-fb-anlz, --analiza-powrotu

-fb-conc, --concorde-powrotu

-fb-dicom, --fallback-dicom

-fb-ecat, --awaryjne-ekat
Wyłącz lub określ zastępczy format odczytu na wypadek niepowodzenia automatycznego wykrywania.

-fh, --odwróć-poziomo

-fv, --odwróć w pionie
Odwróć obrazy poziomo (-fh) wzdłuż osi X, pionowo (-fv) wzdłuż osi Y
odpowiednio. Parametry takie jak orientacja plasterka NIE ulegają zmianie. Zobacz także
-rs opcja.

-fmozaika= X X , --force-mozaika= X X
Wymuś obsługę plików mozaiki w formatach DICOM lub Acr/Nema. *Stemple* będą
podzielić na oddzielne plasterki zgodnie z wartościami podanymi w wierszu poleceń.
Zobacz także dodatkowe opcje -interl i -mfixv. Wstępnie ustawione argumenty to:

= szerokość w pikselach stempli graficznych (X)

= wysokość w pikselach stempli graficznych (Y)

= całkowita liczba stempli wizerunkowych (Z)

lekarz -f plik graficzny -fmozaika=64x64x30

-G, --make-szary
Zmień odwzorowanie kolorowych obrazów na szare. Jest to konieczne podczas konwersji do formatów, które
obsługuje tylko mapę kolorów w skali szarości!

-luka, --odstęp-prawdziwa-przerwa
Odstępy między plasterkami to rzeczywista przerwa/nakładanie się sąsiednich plasterków. W
w przeciwieństwie do domyślnego zachowania, z którego mierzone są odstępy między plasterkami
od środka do środka dwóch sąsiednich plasterków (w tym przerwa/nakładanie się). Zastosowano w
DICOM i Acr/Nema.

-hackar, --hack-acrtags
Umożliwia włamanie się do pliku zawierającego ukryte gdzieś tagi Acr/Nema. Niektóre
zastrzeżone formaty obrazów zawierają znaczniki, ale są umieszczane po nieznanych
informacje o nagłówku. Ta opcja spróbuje znaleźć kilka czytelnych tagów w pierwszym
2048 bajtów, po czym poda kilka możliwych wskazówek, z których można wyciągnąć obrazy
plik z wykorzystaniem procedury interaktywnego odczytu (patrz opcja `-i'). Ten
procedura eksperymentalna może się źle skończyć...

-ja, --interaktywny
Wybiera interaktywną procedurę czytania. Normalnie program automatycznie
wykrywa format lub domyślnie używa „ecat” (lub „dicom”). Z interaktywnym
procedura mogłaby umożliwić odczytanie nieskompresowanego, nieobsługiwanego formatu
odpowiadając na następujące pytania:

Liczba obrazów?
Ogólne przesunięcie nagłówka do danych binarnych?
Przesunięcie nagłówka obrazu do danych binarnych?
Nagłówek obrazu powtarza się przed każdym obrazem?
Zamienić bajty pikseli?
Te same cechy dla wszystkich obrazów?
Bezwzględne przesunięcie w bajtach? (zastępuje powyższe, 0 = nieużywane)
Kolumny obrazów?
Rzędy obrazów?
Typ danych piksela?
Ponowić wprowadzanie?

GUI pozwala na zapisywanie takich surowych plików wejściowych predef (RPI), które mogą być użyte w
instrukcja przekierowania:

lekarz -f nieobsługiwany.img -c intf -i < predef.rpi

W ten sposób możesz tworzyć małe skrypty, które będą odczytywać i konwertować nieobsługiwane obrazy
natychmiast.

-identyfikować, --zidentyfikować
Interaktywna procedura określająca pacjenta i informacje związane z badaniem. Ten
opcji nie można użyć z opcją -anon. Zadawane pytania to:

Podaj nazwisko pacjenta?
Podaj identyfikator pacjenta?
Wybrać płeć pacjenta?
Podaj opis badania?
Podaj identyfikator/nazwę/numer badania?
Podaj opis serii?

-domniemany, --wpisz-domyślnie
Kolejna opcja związana z DICOM, aby wymusić niejawną składnię małego transferu VR jako
wyjście, zamiast domyślnej jawnej składni transferu.

-interl, --mozaika z przeplotem
Dodatkowa opcja używana w połączeniu z wymuszoną mozaiką (-fmosaic). Opcja
wskazuje, że plasterki w oryginalnej mozaice są w rzeczywistości przeplatane. Zobacz też
opcje -fmosaic i -mfixv.

-mały, -- little-endian
Wymuś zapisywanie plików little endian, jeśli jest to obsługiwane przez format.

-lut, --load-lut
Załaduj zewnętrzny schemat kolorów LUT.

-hm, --map-hotmetal
Wybiera mapę kolorów Hotmetal. Jest to przydatne tylko dla GIF89a lub PNG.

-Pan, --map-tęcza
Wybiera mapę kolorów tęczy. Jest to przydatne tylko dla GIF89a lub PNG.

-mc, --map-połączone
Wybiera połączoną mapę kolorów. Jest to przydatne tylko dla GIF89a lub PNG.

-mi, --odwrócona mapa
Wybiera odwróconą mapę kolorów. Jest to przydatne tylko dla GIF89a lub PNG

-mfixv, --mosaic-fix-voxel
Kolejna dodatkowa opcja używana w połączeniu z wymuszoną mozaiką (-fmosaic). Wybieranie
ta opcja spowoduje przeskalowanie rzeczywistych wymiarów wokseli o współczynnik mozaiki.
Zobacz także -fmosaic i -interl.

-mozaika, --włącz mozaikę
Włącz obsługę plików mozaiki w formacie DICOM lub Acr/Nema. *Stemple* będą
podzielone na oddzielne plasterki zgodnie z wartościami znalezionymi w pliku. Ten
procedura autodetect zawsze naprawi rozmiary wokseli. Aby wesprzeć inny rodzaj mozaiki
plików, zobacz opcję -fmosaic.

-N, --negatywy
Zachowaj wartości ujemne. Gdy opcja nie jest wybrana, wszystkie wartości ujemne są ustawiane na zero.
W połączeniu z oznaczaniem ilościowym (patrz -qs lub -qc) żądany format musi obsługiwać
pikseli typu float, globalnego współczynnika przeskalowania lub bardziej ogólnego nachylenia/przecięcia
koncepcji w celu zachowania (ujemnych i dodatnich) wartości ilościowych.

-nf, --normy-nad-ramkami
Normalizuj z wartościami minimalnymi/maksymalnymi znalezionymi na obrazach w grupie ramek (w przypadku
oryginalny format ma inne ramki). Domyślnym zachowaniem jest normalizacja
z minimalnymi/maksymalnymi wartościami znalezionymi na wszystkich obrazach. Może to być ważne, gdy
żądany format wymaga przeskalowania do nowego typu pikseli. Oryginalne wartości pikseli
następnie należy przeskalować do nowych granic typów pikseli w oparciu o
wartości minimalne/maksymalne.

-nometa, --write-bez-meta
Zapisuj pliki DICOM bez nagłówka meta części 10 (grupa 0x0002).

-niepata, --ignore-ścieżka
Zignoruj ​​​​ścieżkę bezwzględną wymienioną w kluczu „nazwa pliku danych” pliku pośredniego
nagłówek. Upewnij się więc, że plik danych znajduje się w tym samym katalogu co plik
plik nagłówkowy.

-bez prefiksu, --bez-przedrostka
Ta opcja wyłącza prefiks numeryczny w nazwie pliku wyjściowego. W połączeniu
z opcją -alias można utworzyć czytelne dla człowieka i posortowane alfabetycznie
plików z wielu woluminów plików DICOM lub Acr/Name.

-o, --nazwa-wyjścia
Zmienia nazwę pliku wyjściowego dla WSZYSTKICH tworzonych plików. Dozwolone jest określenie a
również pełna ścieżka do katalogu. Jednak pełna ścieżka wyłącza unikalną nazwę pliku
przedrostek.

-jeden, --pojedynczy plik
Zapisz nagłówek i obraz w tym samym pliku; jak dozwolone dla InterFile.

-optgif, --opcje-gif
Zdefiniuj niektóre opcje GIF podczas konwersji do formatu GIF. Bez tej opcji a
pętla i kolor tła są zdefiniowane domyślnie. Ta interaktywna procedura zadaje
następujące pytania:

Wybrać mapę kolorów?
Wstawić pętlę wyświetlania?
Opóźnienie 1/100 sekundy?
Wstawić przezroczysty kolor?
Przeźroczysty kolor?
Kolor tła?

-optspm, --opcje-spm
Zdefiniuj niektóre opcje SPM (początki) podczas konwersji do formatu Analiza. The
kwantyfikacja nie jest ustalona. Zobacz także „-spm” i „-ar”. Interaktywna procedura pyta
Następujące pytania:

Pochodzenie X?
Pochodzenie Y?
Pochodzenie Z?

-P, --drukuj wartości
Pokaż określone wartości pikseli. To interaktywna rutyna. Kalibracja i
ujemne piksele są zachowywane automatycznie. Musisz podać -qs do
zachować oznaczenie ilościowe zamiast kalibracji. Nie możesz użyć tej opcji
z -c. Zobacz także opcję -pa dla procedury nieinteraktywnej.

- Dowolna liczba musi opierać się na jedynkach (0 = wszystkie)
- Składnia zakresu : X...Y lub XY
- Składnia interwału: X:S:Y (S = krok)

Rodzaj wyboru? 1=normalny 2=ekot

Normalny styl
------------

Podaj listę numerów obrazów?
Podaj listę pikseli x,y ?

Styl Ecata
----------

Podaj listę samolotów?
Podaj listę ramek?
Podaj listę bramek?
Podaj listę łóżek?
Podaj listę pikseli x,y ?

-rocznie, --drukuj-wszystkie-wartosci
Pokaż wszystkie wartości pikseli. Ta opcja jest identyczna z opcją -p, ale nie wymaga użytkownika
wkład.

-Podkładka, --pad-dookoła

- padtl, --pad-górny-lewy

-padbr, --pad-dolny-prawy
Zwiększenie macierzy plasterków odbywa się poprzez wypełnienie obrazu najniższym pikselem
wartość. Powyższe opcje włączają różne tryby wypełniania.

-preacq, --pozyskiwanie-przedrostków

-konserwator, --przedrostek-serii
Odpowiednio użyj wartości nabycia lub serii w numerowanym przedrostku nowego
Nazwa pliku. Jest to przydatne w przypadku alfabetycznego porządkowania plików, gdzie wiodące są zera
Brak elementów DICOM. Zobacz także -alias.

-Q, --ilościowe
Włącz kwantyfikację przy użyciu wszystkich współczynników skali (na razie alias dla opcji -qc).

-qs, --ujęcie ilościowe
Pierwsza opcja skalowania w celu zachowania kwantyfikacji (ECAT) (a) lub rozważenia a
pierwsze liniowe nachylenie skalowania z punktem przecięcia (b).

qpv = ppv * skala_kwantowa [liczby/sekundę/piksel] (a)
qpv = ppv * nachylenie + wyraz wolny (b)

qpv = określona ilościowo wartość piksela
ppv = zwykła wartość piksela

Współczynnik „quant_scale” normalizuje wszystkie obrazy w pliku; dość ważne dla połączenia
cele. Gdy odpowiedni format nie może pomieścić współczynnika przeskalowania dla każdego obrazu, plik
wartości ilościowe są zapisywane jako zmiennoprzecinkowe. Dlatego najwyższa precyzja pikseli dla poprawności
kwantyfikacja jest zmiennoprzecinkowa, a nie podwójna!

Jeśli format nie obsługuje elementów zmiennoprzecinkowych, skwantyfikowane wartości pikseli zostaną przeskalowane do an
liczba całkowita. Następnie tylko formaty, które obsługują globalny współczynnik skalowania lub parę nachylenie/przecięcie
zachowa te skwantyfikowane wartości.

Zauważ, że tej opcji nie można użyć z opcją -qc.

-qc, --kalibrowanie
Druga opcja oznaczania ilościowego w celu zachowania kwantyfikacji (ECAT), jak również
(ECAT) kalibracja (a) lub ogólnie przy użyciu dwóch przeskalowanych nachyleń z punktem przecięcia
(B). Powinny one normalnie przekształcić piksele w wartości niezależne od producenta.
Można więc założyć, że po kalibracji nowe piksele będą reprezentować rzeczywistość
jednostki świata (takie jak wartości stężeń (SUV), jednostki Hounsfielda (HU) i podobne).

cpv = ppv * skala_kwantowa * kalibr_fctr [uCi/ml] (a)
cpv = ppv * nachylenie1 * nachylenie2 + wyraz wolny (b)

cpv = skalibrowana wartość piksela
ppv = zwykła wartość piksela
qpv = określona ilościowo wartość piksela = ppv * skala_kwantowa

Współczynnik „quant_scale” normalizuje wszystkie obrazy w pliku; dość ważne dla połączenia
cele. „calibr_fctr” przeskalowuje wartości qpv do nowej jednostki. Kiedy odpowiedni
format nie może zawierać współczynnika złożonego dla każdego obrazu, wartości ilościowe zostaną zapisane
jako pływaki. Dlatego najwyższą precyzją pikseli dla poprawnej oceny ilościowej jest liczba zmiennoprzecinkowa i
nie podwójnie!

Jeśli format nie obsługuje elementów zmiennoprzecinkowych, skalibrowane wartości pikseli są przeskalowane do an
typ całkowity. Tylko formaty, które obsługują globalny współczynnik skalowania lub parę nachylenie/przecięcie
zachować te skalibrowane wartości.

Zauważ, że tej opcji nie można użyć z opcją -qs.

-R, --Zmień nazwę pliku
Zmień nazwę pliku basename. Ta opcja jest przydatna tylko w przypadku konwersji.

-rs, --odwrotne-plasterki
Odwróć wszystkie przekroje wzdłuż osi Z. Parametry takie jak orientacja wycinka są
Nie zmieniony. Zobacz także opcje -fh i -fv.

-tak, --cichy
Pomiń wszystkie okna dialogowe komunikatów, ostrzeżeń i błędów.

-zwis, --strzałkowy
Pokrój obrazy objętości na projekcję strzałkową, zachowując rzeczywistość
wymiary świata.

-si= :
Wymuś ponowne mapowanie wartości pikseli przy użyciu określonego nachylenia/przecięcia (y = s*x + i). The
opcja oznaczania ilościowego -qc jest domyślnie włączona. Żadne spacje nie są dozwolone w tym
opcja.

-pomiń1, --skip-podgląd-wycinek
Pomiń pierwszy obraz w InterFile. Innymi słowy, pierwszy obraz w tablicy
zostanie po prostu zignorowany. Użyj tego tylko wtedy, gdy masz pewność, że InterFile to robi
zawierać irytujący/mylący wycinek podglądu.

-split4d, -podział, --podzielone ramki

-split3d, -podziały, --podzielone plasterki
Zapisz badanie w oddzielnych plikach, po jednym dla każdego tomu w ramach czasowych
(--split-frames) lub każdego wycinka obrazu (--split-slices) osobno. nazwy
utworzone pliki będą miały dodatkowy numer indeksu. Zobacz także -stack3d i -stack4d
jako opcje przeciwne.

-spm, --analizuj spm
Rozważanie analizowania plików dla/z SPM. W tym przypadku globalny współczynnik skalowania
zostanie użyte ukryte w imd.funused[1], jak również ukryta wartość przesunięcia w
imd.zabawny[0].

W przypadku oznaczania ilościowego domyślnym typem piksela wyjściowego jest zmiennoprzecinkowy. Ta opcja pozwala
zapisz liczby całkowite połączone z globalnym współczynnikiem skali. Aby faktycznie użyć tego współczynnika skalowania,
należy również wybrać opcję oznaczania ilościowego, taką jak -qs lub -qc.

Zobacz także -ar & -optspm.

-kwadrat, --make-kwadrat
Ustaw wszystkie macierze obrazu jako kwadratowe, używając największego wymiaru. Obrazy są wypełnione
najniższa wartość piksela. Zobacz także opcje związane z -pad.

-kw2, --make-kwadrat-dwa
Ustaw wszystkie macierze obrazów do kwadratu, używając najbliższej potęgi dwójki (pomiędzy 64, 128,
256, 512 i 1024). Obrazy są dopełniane najniższą wartością piksela. Zobacz także -pad
powiązane opcje.

-stos4d, -stosf, --ramki stosowe

-stos3d, -półki na książki, --plasterki-stosu
Zapisz oddzielne badania w jednym pliku. Opcja --stack-slices pozwala na pisanie
pojedyncze pliki plasterków obrazu w jeden wolumin 3D, podczas gdy pozwala na to opcja --stack-frames
tomy z różnych przedziałów czasowych są zapisywane w jednym pliku 4D. Sekwencja
układanie jest oparte na sekwencji plików podanej w wierszu argumentu. Zobacz też
-split3d i -split4d jako opcje przeciwne.

-tra, --poprzeczny
Pokrój obrazy objętości na projekcję poprzeczną, zachowując jednocześnie
wymiary świata rzeczywistego.

-Uin, --use-nazwa-instytucji
Zmień domyślną nazwę instytucji programu, która jest stosowana na studiach bez
jeden. Jednak to ma nie zastąpić istniejące wartości. Dla ciągu nazw ze spacjami,
grupa między podwójnymi cudzysłowami.

-v, --gadatliwy
Tryb szczegółowy. Pokaż kilka komunikatów wyjaśniających podczas czytania i pisania
akta.

-wifi, --edytuj informacje o pliku
Interaktywna procedura do edycji wpisów związanych z wokselami, tablicami, plasterkami i orientacją w
struktura FILEINFO.

-w, --overwrite-pliki
Zezwalaj na zastępowanie istniejących plików bez ostrzeżenia.

UWAGI

Jeśli nie określono konwersji, program wyświetli informacje nagłówkowe każdej z nich
obraz.

Gdy określono konwersję, program automatycznie utworzy nowe nazwy plików w formacie
aktualne katalog o następującej składni:

mXXX-nazwa-pliku.roz

`XXX-' liczba reprezentująca XXX-tą konwersję
`ext' odpowiednie rozszerzenie nowego formatu

Binarny surowy -> .bin
Ascii surowy -> .asc
Gif89a -> .gif
Acr/Nema -> .ima

INW -> .im
ECAT -> .img
Interfile -> .h33 + .i33
Analizuj -> .hdr + .img
DICOM -> .dcm
PNG -> .png
CONC -> .hdr + .dat

Kilka specjalnych uwag związanych z czytaniem ze stdin lub pisaniem na stdout.

a) czytanie od standardowe wejście:

Włącz to, używając znaku „-” zamiast listy plików wejściowych.

1. przekierowanie: lekarz -f - < plik wejściowy

Jest to obsługiwane dla wszystkich formatów i nie powinno powodować żadnych szczególnych problemów. Interaktywny
procedury są wyłączone, ponieważ stdin jest teraz używane przez wejście obrazu.

2. rury: jak plik wejściowy | lekarz -f - format

Właściwie w ten sposób obsługiwany jest tylko jeden lub dwa formaty, ponieważ wywołania seek() nie są
możliwe podczas rur. Faktem jest, że większość naszych formatów jest odczytywana przy użyciu tych funkcji seek()
połączenia. W normalnej eksploatacji potrzebujemy już szybkiego wglądu do pliku w celu ustalenia
format. Ponieważ ta funkcja fseek() nie jest dozwolona, ​​musisz również podać przynajmniej format wejściowy.

b) pisanie do wyjście:

Włączone przez użycie dodatkowego znaku „-” na liście konwersji.

lekarz -f plik wejściowy -c - format

Dozwolony jest tylko jeden plik wejściowy. Przekonwertowane wyjście zostanie wysłane na stdout.

W przypadku podwójnych formatów plików, takich jak Analyze lub InterFile, informacje nagłówka będą następujące
wyślij na stderr. Odniesienie do pliku obrazu w nagłówku pliku InterFile będzie
oczywiście się mylić (ponieważ program nie jest w stanie poznać wynikowej nazwy pliku).

W przypadku wyjścia RAW lub ASCII program wydrukuje zawartość pliku wewnętrznego
Struktura FILEINFO również na stderr. Należy pamiętać, że powłoki (t)csh na to nie pozwalają
przechwyć stderr lub stdout oddzielnie. W przypadku powłoki bash można powiedzieć:

lekarz -f plik wejściowy -c - intf -b16.12 -qc 1>obraz 2>nagłówek

PRZYKŁADY

1. Aby wyświetlić nagłówki obrazów:
medcon -f nazwa_pliku1 nazwa_pliku2

2. Aby przekonwertować obrazy:
medcon -f nazwa_pliku1 nazwa_pliku2 -c gif acr intf

3. Czytać interaktywnie
medcon -i -f nazwa pliku -c ecat

4. Aby wyodrębnić alternatywne obrazy:
medcon -e 1:2:20 -f nazwa pliku -c gif

5. Aby wydrukować wartości pikseli
medcon -p -f nazwa pliku

6. Konwertuj na surowe obrazy binarne, wyślij na standardowe wyjście:
medcon -f nazwa pliku -c - bin

Korzystaj z medcon online, korzystając z usług onworks.net