angielskufrancuskihiszpański

Uruchom serwery | Ubuntu > | Fedora > |


Ulubiona usługa OnWorks

mia-3dbrainextractT1 - Online w chmurze

Uruchom mia-3dbrainextractT1 u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przez Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

To jest polecenie mia-3dbrainextractT1, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

PROGRAM:

IMIĘ


mia-3dbrainextractT1 - Wyodrębnij mózg z obrazu głowy 3D T1 MRI.

STRESZCZENIE


mia-3dbrainextractT1 -i -o [opcje]

OPIS


mia-3dbrainextractT1 Ten program służy do wyodrębniania mózgu z obrazów T1 MR. To pierwsze
uruchamia połączone klasterowanie rozmytych c-średnich i korekcję pola B w celu ułatwienia 3D
segmentacja obrazu 3D. Następnie uruchamiane są różne fitery, aby uzyskać białą materię
segmentacja jako maska ​​początkowa, która jest następnie używana do uruchomienia regionu rosnącego w celu uzyskania maski
cały mózg. Wreszcie maska ​​ta służy do wydobywania mózgu z pola B0
poprawione obrazy.

OPCJE


-i --in-file=(wejście, wymagane); ja
obraz(y) wejściowy do segmentacji Obsługiwane typy plików patrz
WTYCZKI:obraz 3d/io

-o --out-file=(wyjście, wymagane); ja
maska ​​mózgu Obsługiwane typy plików znajdują się w WTYCZKI:3dimage/io

-n --brak klas=3
liczba zajęćliczba zajęć

-w --wm-class=2
indeks istoty białej indeks istoty białej

-p --wm-prob=0.7
klasa istoty białej prawdopodobieństwo początkowego utworzenia maski klasa istoty białej
prawdopodobieństwo utworzenia początkowej maski

-t --próg-wzrostu=20
próg intensywności dla regionu próg intensywności dla regionu uprawy

--wzrost-kształt=18n
region maski sąsiedztwa rośnie

Pomoc & Informacia
-V --verbose=ostrzeżenie
gadatliwość wyjścia, komunikaty drukowane na danym poziomie i wyższych priorytetach.
Obsługiwane priorytety zaczynające się od najniższego poziomu to:
Informacje ‐ Komunikaty niskiego poziomu
wyśledzić ‐ Śledzenie wywołań funkcji
nie ‐ Zgłoś niepowodzenia testu
ostrzeżenie ‐ Ostrzeżenia
błąd ‐ Zgłoś błędy
debug ‐ Wyjście debugowania
wiadomość ‐ Normalne wiadomości
fatalny ‐ Zgłoś tylko błędy krytyczne

--prawa autorskie
drukuj informacje o prawach autorskich

-h --pomoc
wydrukuj tę pomoc

-? --stosowanie
wydrukuj krótką pomoc

--wersja
wydrukuj numer wersji i wyjdź

Przetwarzanie
--wątki=-1
Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, ta liczba powinna być mniejsza
lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w maszynie. (-1:
automatyczne oszacowanie). Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, to
liczba powinna być mniejsza lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w
maszyna. (-1: estymacja automatyczna).

WTYCZKI: obraz 3d/io


w czasie rzeczywistym sprawiają, Przeanalizuj obraz 7.5

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .HDR, .hdr

Obsługiwane typy elementów:
bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, ze znakiem 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy,
zmiennoprzecinkowa 64-bitowa

pula danych Wirtualne IO do i z wewnętrznej puli danych

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .@

dicom Seria obrazów Dicom jako 3D

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .DCM, .dcm

Obsługiwane typy elementów:
16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku

hdf5 HDF5 3D obraz IO

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .H5, .h5

Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, 64-bitowy ze znakiem, 64-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy
punkt 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64-bitowy

inria INRIA obraz

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .INR, .inr

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32-bitowe, zmiennoprzecinkowe 64-bitowe

mhd MetaIO 3D image IO z wykorzystaniem implementacji VTK (eksperymentalne).

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32-bitowe, zmiennoprzecinkowe 64-bitowe

nifti NIFTI-1 3D obraz IO

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .NII, .nii

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, 64-bitowe ze znakiem, 64-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32
bit, zmiennoprzecinkowy 64 bit

vff Format rastrowy VFF Sun

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .VFF, .vff

Obsługiwane typy elementów:
bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy

wzroku Widok 3D

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .V, .VISTA, .v, .vista

Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64
bit

vti Wejście i wyjście obrazu 3D VTK-XML (eksperymentalne).

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .VTI, .vti

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32-bitowe, zmiennoprzecinkowe 64-bitowe

VTK Wprowadzanie i wyprowadzanie starszego obrazu 3D VTK (eksperymentalne).

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64
bit

PRZYKŁAD


Utwórz maskę z obrazu wejściowego, uruchamiając segmentację 5-klasową na obrazie wejściowym
input.v i użyj klasy 4 jako klasy istoty białej i zapisz zamaskowany obraz w masked.v i
obraz skorygowany polem B0 w b0.v

mia-3dbrainextractT1 -i input.v -n 5 -w 4 -o masked.v

Autorski)


Gert Wollny

PRAWA AUTORSKIE


To oprogramowanie jest objęte prawami autorskimi (c) 1999‐2015 Lipsk, Niemcy i Madryt, Hiszpania. Nadchodzi
bez ABSOLUTNIE ŻADNEJ GWARANCJI i możesz ją redystrybuować zgodnie z warunkami GNU
OGÓLNA LICENCJA PUBLICZNA W wersji 3 (lub nowszej). Aby uzyskać więcej informacji, uruchom program za pomocą
opcja '--prawa autorskie'.

Korzystaj z mia-3dbrainextractT1 online, korzystając z usług onworks.net


Ad


Ad