angielskufrancuskihiszpański

Uruchom serwery | Ubuntu > | Fedora > |


Ulubiona usługa OnWorks

micro_razers - Online w chmurze

Uruchom micro_razers u dostawcy darmowego hostingu OnWorks przez Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

Jest to polecenie micro_razers, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks, korzystając z jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

PROGRAM:

IMIĘ


mikro_razy

STRESZCZENIE

mikro-razy [OPCJE]

OPIS

MicroRazerS wykorzystuje strategię mapowania opartą na prefiksach, aby prawdopodobnie mapować małe odczyty RNA
zawierający sekwencję adaptera 3'.

(c) Prawa autorskie 2009 Anne-Katrin Emde.

-h, --help

Wyświetla ten komunikat pomocy.

--wersja

Wyświetlanie informacji o wersji

Główne opcje::

-o, --wyjście FILE

Zmień nazwę pliku wyjściowego. Domyślny: .wynik.

-rr, --współczynnik-rozpoznawania NUM

ustawić procent rozpoznawalności w zakresie [80..100]. Domyślnie: 100.

-sL, -- długość-nasiona NUM

długość nasion W zakresie [10..inf]. Domyślnie: 16.

-sE, --seed-error

pozwól na jeden błąd w nasieniu

-f, --Naprzód

mapa odczytuje tylko do przodu nici.

-r, --odwrócić

mapa odczytuje tylko do odwróconych nici.

-mN, --dopasuj-N

'N' pasuje do wszystkich innych znaków

-m, --max-hits NUM

wyświetla tylko NUM najlepszych trafień w zasięgu [1..inf]. Domyślnie: 100.

-rocznie, --oczyszczanie-niejednoznaczne

czyszczenie odczytów z więcej niż najlepszymi trafieniami z najlepszymi trafieniami

-lm, --słaba pamięć

zmniejszyć zużycie pamięci kosztem czasu pracy

-v, --gadatliwy

tryb gadatliwy

-vv, --vverbose

bardzo gadatliwy tryb

Opcje formatu wyjściowego::

-z, --format wyjściowy NUM

Ustaw format wyjściowy. 0 = format MicroRazerS, 1 = SAM. W zakresie [0..1].

-a, --wyrównanie

zrzuć wyrównanie dla każdego dopasowania

-gn, --nazywanie-genomów NUM

Wybierz sposób nazywania genomów. 0 = użyj identyfikatora Fasta, 1 = wylicz zaczynając od 1. In
zakres [0..1]. Domyślnie: 0.

-rn, --odczyt-nazywania NUM

Wybierz sposób nazywania odczytów. 0 = użyj identyfikatora Fasta, 1 = wylicz zaczynając od 1. In
zakres [0..1]. Domyślnie: 0.

-więc, --sortuj-porządek NUM

Wybierz sposób sortowania dopasowań. 0 = numer odczytu, 1 = pozycja genomu. W zakresie
[0..1]. Domyślnie: 0.

-pf, --format-pozycji NUM

Wybierz numerację pozycji początkowej/końcowej (patrz sekcja Współrzędne poniżej). 0 = odstęp,
1 = miejsce na pozycję. W zakresie [0..1]. Domyślnie: 0.

WERSJA

micro_razers wersja: 1.0.1 Ostatnia aktualizacja Lip 2009

Korzystaj z micro_razerów online, korzystając z usług onworks.net


Ad


Ad