minclookup — online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

minclookup - wykonaj konwersję tabeli przeglądowej na plikach minc

STRESZCZENIE

małe spojrzenie [ ] .mnc .mnc

OPIS

Minclookup wykona operację tabeli przeglądowej na każdym wokselu pliku minc. Wyszukiwanie
Tabela składa się z listy wartości wejściowych z pasującymi wartościami wyjściowymi. Każdy woksel z
plik wejściowy zostaje znaleziony w tabeli przeglądowej i zapisywana jest odpowiadająca mu wartość wyjściowa.
Te wartości wyjściowe mogą być wartościami skalarnymi lub wektorowymi, na przykład wyszukiwaniem kolorów
tabela miałaby cztery kolumny: jedną kolumnę dla wartości wejściowych i jedną kolumnę dla każdego koloru czerwonego,
zielone i niebieskie wartości wyjściowe.

Tabele przeglądowe mogą przybierać jedną z dwóch postaci: ciągły or odrębny.

Ciągła tabela wyszukiwania służy do traktowania wartości wokseli jako wartości ciągłych (rzeczywistych) i
konwertowanie wartości poprzez interpolację między wartościami podanymi w tabeli przeglądowej. A
dyskretna tablica przeglądowa traktuje wartości wejściowe jako liczby całkowite i traktuje je jako kompletne
niezależne wpisy, bez interpolacji.

Najczęstszym zastosowaniem tablic ciągłego wyszukiwania jest konwersja wartości intensywności na
Kolory RGB. Aby uprościć tabele przeglądowe, wszystkie wartości wejściowe są przeskalowane do formatu
zakres od zera do jednego. Domyślnie najmniejsza wartość w pliku jest odwzorowywana na zero i największą
mapy do jednego. Ta wartość jest następnie znajdowana w tabeli przeglądowej, zwykle między dwoma wpisami w
w tabeli (tabela jest zawsze sortowana w porządku rosnącym wartości wejściowych). Liniowy
interpolacja jest następnie wykonywana na każdej kolumnie wyjściowej, a wynikowa wartość (lub wartości) jest
zapisany do pliku wyjściowego. Jeśli istnieje więcej niż jedna wartość wyjściowa na wartość wejściową, to
wymiar vector_dimension jest dodawany do pliku wyjściowego o długości równej podanej liczbie
kolumn wyjściowych w tabeli przeglądowej. W przypadku wartości wejściowych spoza zakresu od zera do jednego,
używana jest najbliższa wartość z tabeli.

Dyskretne tabele przeglądowe są zwykle używane do ponownego mapowania wartości etykiet. Każda wartość wejściowa jest
traktowana jako liczba całkowita (nie jest przeskalowana) i jeśli zostanie znaleziona w tabeli odnośników, to
odpowiednia wartość (lub wartości) jest zapisywana w pliku wyjściowym. Jeśli nie zostanie znaleziony,
następnie wypisywana jest wartość pusta (domyślnie zero). W przypadku dyskretnych nie jest wykonywana interpolacja
tabele przeglądowe — aby uzyskać wartość wyjściową inną niż null, w tabeli musi znajdować się wpis.

OPCJE

Zwróć uwagę, że opcje można określić w formie skróconej (o ile są unikalne) i
można podać w dowolnym miejscu w wierszu poleceń.

Ogólne Opcje

-2 Utwórz plik wyjściowy w formacie MINC 2.0.

-sprać
Zastąp istniejący plik.

-Noclobber
Nie zastępuj istniejącego pliku (domyślnie).

-no_clobber
Synonim dla -Noclobber.

-gadatliwy
Wydrukuj informacje o postępie dla każdego fragmentu skopiowanych danych (domyślnie).

-cichy Nie drukuj informacji o postępie.

-Rozmiar bufora rozmiar
Określ maksymalny rozmiar buforów wewnętrznych (w kilobajtach). Wartość domyślna to 10 MB.

-Typ pliku
Utwórz plik wyjściowy o tym samym typie, co pierwszy plik wejściowy (domyślnie).

-bajt Zapisz każdy woksel jako 8-bitową liczbę całkowitą.

-krótki Zapisz każdy woksel jako 16-bitową liczbę całkowitą.

-wew Zapisz każdy woksel jako 32-bitową liczbę całkowitą.

-długie Zastąpione przez -wew.

-pływak Przechowuj każdy woksel w 32-bitowym formacie zmiennoprzecinkowym.

-podwójnie
Przechowuj każdy woksel w 64-bitowym formacie zmiennoprzecinkowym.

-podpisany
Utwórz plik wyjściowy z danymi przechowywanymi w podpisanym typie. Ta opcja jest bez sensu
gdy jest używany z formatami danych zmiennoprzecinkowych, które są zawsze podpisane.

-bez znaku
Utwórz plik wyjściowy z danymi przechowywanymi w typie bez znaku. Ta opcja jest
bez znaczenia, gdy jest używany z formatami danych zmiennoprzecinkowych.

-Prawidłowy zakres min max
Skaluj wartości wokseli liczb całkowitych, aby mieściły się między wartościami min i max. Domyślnie
całkowite wartości wokseli zostaną przeskalowane, aby wykorzystać cały zakres typu podstawowego. Ten
opcja jest bez znaczenia, gdy jest używana z formatami danych zmiennoprzecinkowych.

Lookup stół Opcje

-szary Użyj szarej tabeli przeglądowej, aby zapisać wartości RGB (domyślnie).

-szary Synonim dla -szary.

-gorący metal
Użyj tabeli wyszukiwania gorących metali, aby zapisać wartości RGB.

-widmowy
Użyj widmowej (tęczowej) tabeli przeglądowej, aby wypisać wartości RGB.

-odwracać
Odwróć tabelę przeglądową, tak aby maksymalna wartość była odwzorowywana na zero i minimum
mapy wartości do jednego. Dotyczy tylko ciągłych tabel wyszukiwania.

-nieodwróć
Nie odwracaj tabeli przeglądowej — mapy minimalne do zera, a mapy maksymalne do
jeden (domyślnie).

-zasięg min max
Określ zakres wartości, które mają być odwzorowane na zakres tabeli przeglądowej
(domyślnie pełny zakres pliku wejściowego).

-minimum min
Określ wartość wejściową, która odpowiada wartości minimalnej w tabeli przeglądowej.

-maksymalny max
Określ wartość wejściową, która odpowiada wartości maksymalnej w tabeli przeglądowej.

-wyszukiwarka_tabeli [filet | -]
Określ nazwę pliku zawierającego tabelę przeglądową. Jeśli - jest podane, wyszukiwanie
tablica jest odczytywana ze standardowego wejścia. Plik musi mieć co najmniej dwie kolumny: The
pierwsza kolumna podaje wartości wejściowe; inne kolumny podają odpowiednie
wartości wyjściowe. W przypadku tabeli wyszukiwania ciągłego pierwsza kolumna powinna zawierać a
wartość od zera do jednego włącznie Jawne wpisy zarówno dla zera, jak i dla jedynki
zwykle dać. W przypadku dyskretnej tabeli przeglądowej pierwsza kolumna powinna zawierać
wartości całkowite. Jeśli podano więcej niż jedną kolumnę wyjściową, plik wyjściowy będzie
mieć wymiar wymiar_wektorowy o długości równej numerowi wyjścia
kolumny. W razie potrzeby wiersze tabeli zostaną posortowane tak, aby pierwszy
kolumna jest w porządku rosnącym.

-lut_string ciąg-tabeli wyszukiwania
Określ pełną tabelę wyszukiwania jako pojedynczy ciąg. Znak średnika „;”
służy do oddzielania linii.

-ciągły
Tabela przeglądowa jest ciągła (patrz opis powyżej): Wartości wejściowe są traktowane jako
ciągłych (rzeczywistych) wartości i są przeskalowane do zakresu od zera do jednego przed byciem
spojrzał w górę; interpolacja jest wykonywana między wartościami w tabeli. To jest ustawienie domyślne
zachowanie.

-oddzielny
Tabela przeglądowa jest dyskretna (patrz opis powyżej): Wartości wejściowe są traktowane jako
całkowitymi i nie jest wykonywana interpolacja między wartościami wejściowymi.

-null_wartość ciąg-wartości-zerowej
Określ wartość pustą, która ma być używana z dyskretnymi tabelami wyszukiwania, gdy wartość nie jest
znaleźć w tabeli przeglądowej. Ta wartość musi być określona jako lista oddzielona przecinkami
wartości, z taką samą liczbą wartości jak kolumny wyjściowe w tabeli przeglądowej.

Rodzajowy Opcje dla cała kolekcja polecenia:

-Pomoc Wydrukuj podsumowanie opcji wiersza poleceń i zakończ.

-wersja
Wydrukuj numer wersji programu i zakończ.

PRZYKŁADY

Aby uzyskać obrazy RGB gorącego metalu z pliku MRI:

minclookup -hotmetal wejście.mnc wyjście.mnc

Aby przekonwertować etykiety w pliku etykiet minc, użyj opcji -discrete:

minclookup -discrete -lookup_table plik wyszukiwania \
in_labels.mnc out_labels.mnc

gdzie plik wyszukiwania jest plikiem zawierającym wpisy do odwzorowania etykiety 2 na 4 i etykiety 3 na 5:

2 4
3 5

Możesz również określić tę tabelę przeglądową w wierszu poleceń:

minclookup -discrete -lut_string '2 4;3 5' \
in_labels.mnc out_labels.mnc

Aby uzyskać szary plik RGB, z czerwonym dla wartości mniejszych niż minimum i zielonym dla wartości
większy niż minimum, można podać dwa wpisy zerowe i dwa wpisy jednoznaczne. Pierwszy
zero jest używane dla wartości ujemnych, drugie zero służy do interpolacji do następnego
wejście. Nie ma dwuznaczności, jak obsługiwać wartość dokładnie zerową, ponieważ pierwsza
i ostatnie wartości tabeli są obsługiwane w specjalny sposób, aby upewnić się, że tak jest
traktowane jako mieszczące się w zakresie, jeśli wystąpi taka sytuacja z dwoma wejściami.

minclookup -lookup_table - input.mnc output.mnc <
0 1 0 0
0 0 0 0
1 1 1 1
1 0 1 0
EOF

Aby odwrócić obraz skalarny, możesz użyć minclookup:

minclookup -lut_string '0 1;1 0' in.mnc out.mnc

Korzystaj z minclookup online, korzystając z usług onworks.net