Jest to polecenie obconformer, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
obkonformista — wygenerować współrzędne konformera
STRESZCZENIE
obkonformista # of konformery # of optymalizacja kroki filename
OPIS
Narzędzie obconformer może być używane jako część badania konformacyjnego poprzez generowanie losowych
konformistów za pomocą wyszukiwania Monte Carlo. Najlepszy konformer z partii konformerów
zostanie wydrukowany po wykonaniu podanej liczby kroków optymalizacji geometrii. Domyślnie,
obconformer wykorzystuje pole siłowe MMFF94.
PRZYKŁADY
obconformer 250 100 baseconformer.sdf >rotamer1.sdf
Wygeneruj najlepszy konformer (z 250) z baseconformer.sdf i zapisz go do rotamer1.sdf
po 100 krokach optymalizacji geometrii
Korzystaj z obconformer online, korzystając z usług onworks.net
