To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie bspipe, której najnowszą wersję można pobrać jako bspipe-1.3.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie bspipe z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
bspipe
Ad
OPIS
BSpipe to kompleksowy proces od kontroli jakości sekwencji i mapowania do analizy funkcjonalnej regionów o zróżnicowanej metylacji:
(1) ocena jakości sekwencjonowania,
(2) czyszczenie sekwencji,
(3) mapowanie odczytu sekwencji,
(4) kwantyfikacja metylacji,
(4) porównania próbek na podstawie profilu metylacji,
(5) identyfikacja DMR (regiony o różnej metylacji),
(6) adnotacja DMR,
(7) analiza funkcjonalna genów metylowanych różnicowo,
(8) generowanie plików wejściowych do wizualizacji oraz
(9) obsługa zaawansowanych technologii sekwencjonowania, takich jak TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it i NOMe-seq.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Powłoka Unix, Perl, S/R
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/bspipe/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
