Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie CaptureProbe, której najnowszą wersję można pobrać jako Runningexample.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie CaptureProbe z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
Przechwytywanie sondy
Ad
OPIS
Tutaj opracowaliśmy CaptureProbe, przyjazne dla użytkownika i graficzne narzędzie Java do projektowania sond przechwytywania dla aplikacji Capture Hi-C. CaptureProbe jest łatwy w użyciu, wymaga tylko prostych plików wejściowych i zapewnia wiele parametrów do projektowania sond. CaptureProbe może projektować sondy specjalnie dla miejsc genomicznych i regionów genomu będących przedmiotem zainteresowania. Porównania z istniejącym oprogramowaniem (HiCapTools i GOPHER) wykazały, że CaptureProbe ma dobry współczynnik sukcesu projektowego i lepszą specyficzność sondy.
Cytowanie: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: narzędzie Java do projektowania sond do aplikacji przechwytywania Hi-C. Zool Res [J], 41: 94-96.
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
