To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie FamSeq, której najnowszą wersję można pobrać jako FamSeq1.0.2.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie FamSeq z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
FamSeq
Ad
OPIS
Nadal trudno jest nazwać rzadkie warianty. W rodzinnych badaniach sekwencjonowania należy wykorzystać informacje od wszystkich członków rodziny, aby dokładniej zidentyfikować nowe mutacje linii zarodkowej. FamSeq służy temu celowi, zapewniając prawdopodobieństwo, że osoba jest nosicielem wariantu, biorąc pod uwagę surowe pomiary całej rodziny. FamSeq obsługuje mutacje de novo i może wykonywać wywołania wariantowe na chromosomie X.
Aby uwzględnić różnice w złożoności danych, FamSeq składa się z trzech różnych implementacji mendlowskiego modelu genetycznego: algorytmu sieci Bayesa, algorytmu Elstona-Stewarta i algorytmu Monte Carlo łańcucha Markowa. Aby oprogramowanie było wydajne i odpowiednie dla dużych rodzin, zrównolegliliśmy algorytm sieci Bayesa, który radzi sobie z rodowodami z pętlami chowu wsobnego bez utraty precyzji obliczeń na procesorze graficznym NVIDIA®.
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
C + +
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/famseq/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
