To jest aplikacja Linux o nazwie FishingCNV do uruchomienia w Linuksie online, której najnowszą wersję można pobrać jako FishingCNV_1.5.3.zip. Można ją uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom bezpłatnie aplikację FishingCNV, aby uruchomić ją w systemie Linux online za pomocą OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
FishingCNV będzie działać w systemie Linux online
OPIS
FishingCNV, narzędzie programowe opracowane na Uniwersytecie McGill, jest narzędziem do kompleksowej analizy rzadkich zmian liczby kopii w wysokowydajnych danych sekwencjonowania egzomu. Dane wejściowe to standardowe pliki pokrycia utworzone przez Genome Analysis ToolKit (GATK), a dane wyjściowe to plik zawierający domniemane CNV.Program jest dostępny w 2 różnych wersjach
* Wersja GUI (FishingCNV_X.XXzip)
* Wersja wiersza poleceń (FishingCNV_X.X_pipeline)
Przejrzyj nasze pliki, aby znaleźć różne wersje.
Funkcjonalności
- Graficzny interfejs użytkownika
- Analiza CNV dla dopasowanego testu/kontroli (np. rak/guz)
- Analiza CNV dla niedopasowanych próbek
- Usuwanie efektu wsadowego w zestawie kontrolnym
- Dane wyjściowe rozdzielane tabulatorami można wyświetlać w programie Excel
- Dodatkowy plik wyjściowy można wizualizować w IGV
- Wykresy dystrybucji i wykresy wartości odstających dla każdego chromosomu
Publiczność
Nauka/Badania, Edukacja
Interfejs użytkownika
Huśtawka Java
Język programowania
Jawa, S/R
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/fishingcnv/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
