Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie FMFilter do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać w pliku samplefiles.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie FMFilter, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
FMFilter do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
Odfiltrowanie widocznej części przez nadmierną ilość informacji wytwarzanych przez techniki nowej generacji jest trudnym zadaniem. Obecne narzędzia umożliwiają analizę danych sekwencjonowania nowej generacji różnymi metodami. Jednak nadal istnieje zapotrzebowanie na szybkie, łatwe w użyciu i skuteczne narzędzia. Zapewniamy wydajne narzędzie do filtrowania danych sekwencjonowania nowej generacji uzyskanych w badaniach nad chorobami genetycznymi. FMFilter pozwala wybrać jeden z modeli dziedziczenia (recesywny, dominujący, złożony heterozygotyczny i de novo), osoby dotknięte chorobą oraz osoby kontrolne w celu zaprojektowania mechanizmu filtrowania. Zapewnia środowisko do analizy tych przypadków, usuwając wymóg stosowania zaawansowanych technik komputerowych. Ma możliwość filtrowania z osobnikami kontrolnymi i eliminowania większości fałszywych alarmów charakterystycznych dla populacji. Wymaga znikomej pamięci, co pozwala na obsługę bardzo dużych plików wariantów na zwykłych komputerach.Funkcjonalności
- Analiza modelu autosomalnego recesywnego
- Analiza modelu autosomalnego dominującego
- Złożona analiza heterozygotyczna
- Analiza de novo
- Obsługa bardzo dużych plików wariantów na zwykłych komputerach
Interfejs użytkownika
Qt
Język programowania
C++, C
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/fmfilter/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
