To jest aplikacja Linux o nazwie JSiteDescriptor, której najnowszą wersję można pobrać jako binaries.zip. Można ją uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie JSiteDescriptor z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
JSiteDescriptor
Ad
OPIS
Zestaw programów Java, które wyodrębniają współrzędne i informacje chemiczne z plików PDB.
Regiony miejsc wiązania są wyodrębniane przy użyciu schematu opartego na siatce.
Dla miejsca wiązania generowany jest deskryptor przestrzenno-chemiczny w oparciu o algorytm PocketMatch dr Kalidasa (również autora tego projektu).
Funkcjonalności
- Generowanie deskryptora wektora opartego na PocketMatch dla miejsca wiązania
- Działa w trybie pojedynczego pliku PDB lub w trybie wsadowym
- Specyfikacja miejsca jako sąsiedztwa liganda - (kod liganda, nazwa i identyfikator łańcucha)
- Specyfikacja terenu jako sąsiedztwo podzbioru PDB przy użyciu WYRAŻEŃ REGULARNYCH
- Specyfikacja wielu zakresów atomów wyściełających miejsce wiązania
- Plik przetwarzania w trybie wsadowym przechwytuje parametry wejściowe za pośrednictwem pliku XML + zgodnego ze specyfikacją XSD
- Większa konfigurowalność - wybór grup reszt, promień i kategorie dla witryn
- Technologia Java Swing dla GUI
- Prosta i rozszerzalna architektura oprogramowania do przyszłego rozwoju
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Huśtawka Java
Język programowania
Java
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
