Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, której najnowszą wersję można pobrać jako meta_phat.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie MetaPhat -meta-pheno-association-tracker z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
MetaPhat - narzędzie do śledzenia skojarzeń meta-feno
OPIS
MetaPhat to aktywne i otwarte (licencja MIT) narzędzie do wykrywania wariantów z wielowymiarowymi powiązaniami za pomocą statystyk podsumowujących z jednowymiarowych badań GWAS. Aplikacja przeprowadza również dekompozycję, znajdując optymalne podzbiory BIC i cechy kierujące wartością P dla wielowymiarowych wariantów wiodących. Warianty wyników są śledzone i grupowane, aby pomóc w analizie relacji fenotyp-genotyp.Odwiedź naszą stronę wiki, aby uzyskać instrukcje instalacji, wymagane formaty danych GWAS i przykładowe dane wejściowe z poleceniem testowym - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Globalne lipidy (GLGC, Willer 2013) dane/przykład smoły źródłowej - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Jeśli napotkasz problemy lub masz prośby o dodanie funkcji po wypróbowaniu przykładu i przeczytaniu samouczka, wyślij e-mail: [email chroniony]
Prawa autorskie <2019> [email chroniony], [email chroniony]
Korzyści
- wielowymiarowa analiza cech całego genomu
- Wybór optymalnego podzbioru cech na podstawie wartości p i BIC
- wykresy śladowe rozkładu cech
- główny plik podsumowania cech SNP i kierowcy
- snp-snp cecha ranga klaster włóczników
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.