To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie MoPAC, której najnowszą wersję można pobrać jako MoPAC_0.3.1.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie MoPAC z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
MoPAC
OPIS
Aby ułatwić porównanie istotności genów w dwóch lub większej liczbie próbek komórek, proponujemy MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens), interaktywne narzędzie oparte na Shiny do różnicowej analizy istotności na ekranach CRISPR/Cas9.
Instrukcje dotyczące instalacji i użytkowania można znaleźć na stronie wiki.
Funkcje
- Bezstronny pomiar różnicowej istotności genów na ekranach CRISPR.
- Łatwość obsługi dzięki interaktywnej graficznej interfazie użytkownika.
- Dane gotowe do publikacji generowane na każdym etapie analizy.
- Jako dane wejściowe dozwolone są zarówno pliki FASTQ, jak i tabele odczytów (przed lub po normalizacji).
- Kontrola jakości oparta na kategoriach genów w celu wykrywania i filtrowania wartości odstających.
- Analiza ontologii genów wbudowana w pakiet STRINGdb R.
- Szybkie przetwarzanie dzięki kompilacji w języku C++ kroków wymagających intensywnych obliczeń.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Oparte na sieci Web
Język programowania
C++, S/R
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/mopac/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
