Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie MSTgold, której najnowszą wersję można pobrać jako MSTgoldpackage.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie MSTgold z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
MSTzłota
Ad
OPIS
Algorytmy minimalnego drzewa opinającego (MST) mogą generować wiele równie minimalnych MST, ale programy MST zwykle zgłaszają tylko jeden, arbitralnie wybrany MST. Podobnie większość programów MST nie dostarcza metryk statystycznych wspierających wiarygodność szacowanych przez nie MST.
MSTgold szacuje liczbę alternatywnych MST, raportuje do określonej przez użytkownika liczby tych drzew, raportuje drzewo konsensusu i implementuje metrykę ładowania początkowego w celu oceny niezawodności alternatywnych rozwiązań MST.
MSTgold akceptuje dane jednoznakowe, które są nukleotydami, aminokwasami, znakami binarnymi lub SNP; liczby całkowite reprezentujące na przykład długości VNTR lub mikrosatelitów; i macierze odległości.
Pakiet MSTgold zawiera pliki wykonywalne programu MSTgold dla systemów Mac OS X, Linux i Windows, szczegółową instrukcję obsługi, przykładowe dane i wyniki oraz pliki wykonywalne programu Fasta2MSTG, który konwertuje pliki sekwencji Fasta do formatu wejściowego MSTgold.
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/mstgold/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.