To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie pipasic, której najnowszą wersję można pobrać w formacie README.txt. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie pipasic z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
pipasic
OPIS
Analiza metaproteomiczna umożliwia badanie wzajemnych oddziaływań organizmów lub grup funkcjonalnych i staje się coraz bardziej popularna także w celach diagnostycznych. Jednakże pojawiają się trudności ze względu na duże podobieństwo sekwencji między pokrewnymi organizmami. Co więcej, stan zachowania białek między gatunkami można powiązać z poziomem ich ekspresji, co może prowadzić do znacznych błędów w wynikach i interpretacji. Wyzwania te są podobne, choć nie identyczne, z wyzwaniami pojawiającymi się podczas analizy próbek metagenomicznych i wymagają specyficznych rozwiązań.
pipasic (korekta podobieństwa liczebności proteomów ważona intensywnością peptydów) to narzędzie, które koryguje wyniki kwantyfikacji oparte na identyfikacji i zliczaniu widmowym przy użyciu estymacji podobieństwa peptydów i ważenia poziomu ekspresji w nieujemnym środowisku lasso. pipasic ma wyraźną przewagę nad podejściami dotyczącymi wyłącznie unikalnych peptydów lub agregowania wyników do najniższego wspólnego przodka.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Python
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/pipasic/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
