To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie PPSeq: Parallel NGS Analysis do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie PPSeq: Parallel NGS Analysis, aby działać w systemie Linux online z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
PPSeq: równoległa analiza NGS do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
Technologia wysokowydajnego sekwencjonowania nowej generacji (NGS) szybko stała się potężnym narzędziem w wielu aspektach badań biomedycznych. Jednak wraz z szybkim rozwojem, wielkość danych i złożoność analizy dla NGS znacznie przekraczają pojemność i możliwości tradycyjnych małych urządzeń obliczeniowych, takich jak algorytmy wielowątkowe na samodzielnych stacjach roboczych. Aby rozwiązać ten problem, przedstawiamy tutaj rozwiązanie wykorzystujące stale rosnącą podaż mocy obliczeniowej przez systemy masowego przetwarzania równoległego (MPP).Korzyści
- ppalgn - dopasowywanie odczytów sekwencjonowania do długich sekwencji referencyjnych
- ppbwt - budowanie indeksu FM z zestawu sekwencji DNA
Publiczność
Edukacja, inżynieria, przemysł opieki zdrowotnej, technologie informacyjne, organizacje non-profit, nauka/badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
C + +
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
