Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie QSdpR do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako QSdpR_v3.2.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie QSdpR, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
QSdpR do uruchomienia w systemie Linux online
Ad
OPIS
Jest to oprogramowanie do rekonstrukcji quasigatunków wirusów dla problemu składania quasigatunków na wirusach mRNA, które opiera się na podejściu do grupowania korelacji i wykorzystuje półokreślone ramy optymalizacji. Oprogramowanie akceptuje genom referencyjny, zestaw odczytów NGS dopasowany do tego odniesienia i zestaw lokalizacji SNP w postaci pliku vcf i generuje optymalny zestaw zrekonstruowanych genomów gatunków, który opisuje podstawową populację wirusów.Funkcjonalności
- Quasigatunki
- wirus mRNA
- Klastry
- Program półokreślony
- Wirus HIV-1
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Powłoka uniksowa, Python, C
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/qsdpr/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.