Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie SeqSelector, której najnowszą wersję można pobrać jako SeqSelector1.1b.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie SeqSelector z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
SeqSelector
Ad
OPIS
Zestaw narzędzi SeqSelector to zestaw przyjaznych dla użytkownika, niezależnych od platformy skryptów Pythona, które ułatwiają wybór sekwencji do ukierunkowanego wzbogacania bibliotek nowej generacji poprzez przechwytywanie sekwencji oparte na hybrydyzacji. Skrypty nie wymagają znajomości programowania i mogą być stosowane do sekwencji genomu gatunków modelowych lub niemodelowych. Sugerujemy przepływ pracy, w którym geny będące przedmiotem zainteresowania są najpierw identyfikowane z poprzednich badań i publicznie dostępnych zbiorów danych dotyczących funkcjonalnej adnotacji genów. Po zidentyfikowaniu listy genów kandydujących, ich sekwencje wybiera się z genomu referencyjnego. Te sekwencje są używane jako zapytanie podczas przeszukiwania BLAST nieopisanego genomu gatunku niemodelowego, a następnie zwracane są odpowiednie sekwencje, które można stosować do projektowania przynęt do wychwytywania sekwencji opartej na hybrydyzacji.
Język programowania
Python
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/seqselector/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
