To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie StatAlign, której najnowszą wersję można pobrać jako StatAlign-v2.1.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie StatAlign z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
Wyrównaj statystyki
Ad
OPIS
StatAlign to rozszerzalny pakiet oprogramowania do analizy bayesowskiej sekwencji białek, DNA i RNA. Wielokrotne wyrównania, drzewa filogenetyczne i parametry ewolucyjne są współszacowane w ramach Markov Chain Monte Carlo, co pozwala na wiarygodny pomiar dokładności wyników.
Takie podejście eliminuje typowe artefakty, na które cierpią tradycyjne metody, kosztem zwiększonego czasu obliczeniowego. Te artefakty obejmują zależność skonstruowanej filogenezy od pojedynczego (prawdopodobnie nieoptymalnego) wyrównania i nastawienie w kierunku drzewa przewodniego, na którym opiera się to wyrównanie.
Modele stojące za analizą pozwalają na porównanie ewolucyjnie odległych sekwencji: model insercji-delecji TKF92 można połączyć z dowolnym modelem podstawienia. W pakiecie znajduje się szeroka gama modeli danych dotyczących nukleotydów i aminokwasów, a system zarządzania wtyczkami zapewnia łatwe dodawanie nowych modeli.
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/statalign/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
