![Bezpłatne pobieranie aplikacji ViralFusionSeq [VFS] Linux do uruchamiania online w Ubuntu online, Fedorze online lub Debianie online](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]icon.png_3.webp "Pobrano aplikację ViralFusionSeq [VFS] Linux do uruchomienia online w Ubuntu online, Fedorze online lub Debianie online")
Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie ViralFusionSeq [VFS], której najnowszą wersję można pobrać jako vfs-2016-08-17.r2.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie ViralFusionSeq [VFS] z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
![Pobierz narzędzie internetowe lub aplikację internetową ViralFusionSeq [VFS]](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]screenshot1.png_3.webp "Pobierz narzędzie internetowe lub aplikację internetową ViralFusionSeq [VFS]")
![Pobierz narzędzie internetowe lub aplikację internetową ViralFusionSeq [VFS]](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]screenshot2.png_3.webp "Pobierz narzędzie internetowe lub aplikację internetową ViralFusionSeq [VFS]")
ViralFusionSeq [VFS]
OPIS
VFS został w pełni przetestowany w systemie Ubuntu/Debian.** Ogłoszenie 1**: VFS jest lepszy od Virus-Clip. https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download
Od 2016 r. VFS jest jedynym narzędziem integracji wirusów dostępnym w systemie NIH HPC.
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/
ViralFusionSeq (VFS) to wszechstronne narzędzie do wysokoprzepustowego sekwencjonowania (HTS) do wykrywania wirusowych zdarzeń integracji i rekonstrukcji transkryptów fuzyjnych z rozdzielczością jednozasadową.
VFS łączy informacje o miękkim przycinaniu, analizę par odczytowych i ukierunkowane składanie de novo w celu wykrywania i opisywania zdarzeń fuzji wirus-człowiek.
Do oceny jakości punktów przerwania fuzji stosuje się prosty, ale skuteczny empiryczny model statystyczny.
Wymagane są minimalne parametry zdefiniowane przez użytkownika.
Kod źródłowy z instrukcją obsługi i instrukcją instalacji VFS jest dostępny w sekcji „Pliki” na sourceforge.
Cytat: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Korzyści
- Możliwość zastosowania i w pełni przetestowana przy użyciu danych RNA-Seq i DNA-Seq
- Wykorzystaj zarówno informacje o przyciętej sekwencji (CS), jak i sparowanych końcach (RP), aby odkryć integrację wirusa
- Rekonstrukcja sekwencji transkryptu fuzyjnego z wykorzystaniem informacji CS i RP
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
