Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie AutoDockParser, której najnowszą wersję można pobrać jako AutodockParser.exe. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie AutoDockParser z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
AutoDockParser
Ad
OPIS
AutoDock Suit to jedno z najpopularniejszych programów do wykonywania dokowania molekularnego i wirtualnych badań przesiewowych. Kombinezon ten oferuje dwa programy AutoDock i AutoDock Vina. AutoDock udostępnia swoje dane wyjściowe w postaci plików dziennika dokowania (pliki DLG), podczas gdy te drugie w formacie pdbqt.
Przetwarzanie końcowe tych wyników przez długi czas pozostawało zadaniem ręcznym, dlatego opracowano różne protokoły i przepływy pracy dostosowane do potrzeb użytkownika. Ręczne przetwarzanie tych wyników do późniejszej analizy interakcji pozostaje czasochłonnym i pozornie przyziemnym zadaniem. Przetwarzanie ręczne wiąże się z zależnością od różnych programów zewnętrznych.
AutoDock Parser oferuje automatyczne przetwarzanie końcowe wyników dokowania uzyskanych z narzędzia AutoDock Suit. AutoDock Parser to przyjazne dla użytkownika narzędzie, którego celem jest zminimalizowanie wysiłku związanego z przetwarzaniem końcowym wyników dokowania. Umożliwia użytkownikowi tworzenie kompleksów białko-ligand z wejściowych plików DLG/PDBQT w jednym kroku.
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/autodockparser/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.